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Identificação de genes de predisposição à síndrome do carcinoma de mama e tireoide por sequenciamento total do exoma

Processo: 14/03983-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de setembro de 2014
Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Silvia Regina Rogatto
Beneficiário:Maísa Pinheiro
Instituição-sede: Faculdade de Medicina (FMB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Assunto(s):Neoplasias mamárias   Neoplasias da glândula tireoide   Exoma

Resumo

Estima-se que 5 a 10% dos cânceres humanos fazem parte de síndromes de cânceres hereditários (SCH), enquanto 15 a 20% dos casos pertencem a agrupamentos familiais de câncer, cujos fatores hereditários são desconhecidos. A etiologia dos tumores sólidos, incluindo o Carcinoma de Mama (CM) e o Carcinoma de Tireoide (CT) é multifatorial, dependente de fatores ambientais e genéticos que desempenham um papel variável no desenvolvimento da doença. No entanto, uma parcela significativa destes tumores está associada com um componente hereditário. Logo, a identificação de fatores de predisposição e a caracterização de fatores genéticos de risco são essenciais para o diagnóstico, prognóstico e aconselhamento genético dos pacientes afetados e seus familiares. Durante o período de vigência da bolsa de mestrado, aprovado pela FAPESP (processo 2012/12714-5), foram selecionadas 24 amostras de sangue periférico de pacientes que se encaixavam nos seguintes critérios: probando com CT (não medular) e/ou CM e com histórico familial destes tumores; pelo menos dois familiares de 1º ou 2º grau com idade de diagnóstico destes tumores inferior a 45 anos ou; um familiar com um dos dois tumores e probando com diagnóstico abaixo dos 40 anos e; outros tumores em outras gerações que não aquela acometida por CM e CT (não medular). Foram excluídos do estudo pacientes do sexo feminino com CM tratado por radioterapia seguido de CT não medular, casos de CT medular, pacientes com alterações em genes associados a outras síndromes hereditárias. A partir desta casuística quatro amostras tumorais de um subgrupo destes pacientes foram selecionadas, resultando em 28 amostras de DNA para a análise de exoma. As amostras foram sequenciadas no equipamento HiSeq 1000 (Illumina) (ESALQ-USP), utilizando o kit Nextera Exome Enrichment (Illumina). As bases foram nomeadas (base-calling), as sequências geradas foram limpas, mapeadas e o primeiro levantamento das variantes foi realizado. Baseado no número de análises necessárias para a conclusão do estudo, bem como as dificuldades encontradas, como a disponibilidade das amostras e problemas técnicos com o equipamento, foi solicitada e aprovada a promoção de Mestrado para Doutorado junto ao programa de pós-graduação. Para a publicação dos dados há a necessidade de uma análise elaborada e robusta, confirmação e validação dos resultados. Por esta razão está sendo solicitada bolsa de doutorado direto para a conclusão deste estudo. Sendo assim este estudo tem como objetivo a identificação de genes de predisposição ao desenvolvimento de CM e CT por meio da análise do exoma total, em pacientes que sejam afetados por pelo menos um destes tumores e possuam história familial de câncer. Análises de bioinformática encontram-se em andamento. Em conclusão a detecção e a definição de novas alterações genéticas associadas com estes tumores podem ampliar o espectro de síndromes associadas ao câncer e permitir a identificação de pacientes com risco aumentado de desenvolver estes tumores. Este estudo tem potencial para contribuir para o diagnóstico molecular e aconselhamento genético destes pacientes e suas famílias. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PINHEIRO, MAISA; DRIGO, SANDRA APARECIDA; TONHOSOLO, RENATA; ANDRADE, SONIA C. S.; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; JURISICA, IGOR; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ACHATZ, MARIA ISABEL; ROGATTO, SILVIA REGINA. HABP2 p.G534E variant in patients with family history of thyroid and breast cancer. ONCOTARGET, v. 8, n. 25, p. 40896-40905, JUN 20 2017. Citações Web of Science: 0.

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