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Identificação de eQTLs e estudo de regiões genômicas associadas à deposição e composição da gordura intramuscular em animais da raça Nelore

Processo: 14/11871-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2014
Vigência (Término): 31 de julho de 2018
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luiz Lehmann Coutinho
Beneficiário:Aline Silva Mello Cesar
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:12/23638-8 - Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore, AP.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):14/22884-0 - Identificação de eQTLs e estudo de regiões genômicas associadas à deposição e composição da gordura intramuscular em animais da raça Nelore, BE.EP.PD
Assunto(s):Ácidos graxos   Bos taurus indicus

Resumo

A quantidade e composição da gordura intramuscular (GIM) podem influenciar as características sensoriais, o valor nutricional da carne bovina e a saúde humana, uma vez que o perfil dos seus ácidos graxos pode se apresentar de maneira diversificada conforme a genética, o manejo e a nutrição dos animais de origem. A deposição e composição da gordura são determinadas por muitos genes que participam direta ou indiretamente da adipogênese e do metabolismo lipídico. Na última década, presenciamos um grande avanço na área da genômica bovina que resultou no sequenciamento completo do genoma, no desenvolvimento de estratégias de sequenciamento de RNA para estudos de expressão gênica e chips de alta densidade de SNP para genotipagem. O objetivo deste estudo é integrar informações de genotipagem e de sequenciamento de mRNA para mapear regiões de eQTL associadas à deposição e composição de gordura intramuscular, assim como caracterizar a arquitetura genética da expressão gênica. Os dados de genotipagem (390 animais) já foram obtidos pelo presente grupo e o sequenciamento do mRNA total será obtido a partir de 200 amostras do músculo Longissimus dorsi de machos castrados da raça Nelore. As regiões de eQTL identificadas no presente projeto ampliarão o conhecimento dos mecanismos biológicos envolvidos com a biossíntese de ácidos graxos em bovinos. Estes resultados irão compor a base de dados do projeto Temático "Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore" (Processo 2012/23638-8), contribuindo para o conhecimento da regulação dos processo biológicos envolvidos com fenótipos de interesse econômico.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
KAPPELER, BERNA I. G.; REGITANO, LUCIANA C. A.; POLETI, MIRELE D.; CESAR, ALINE S. M.; MOREIRA, GABRIEL C. M.; GASPARIN, GUSTAVO; COUTINHO, LUIZ L. MiRNAs differentially expressed in skeletal muscle of animals with divergent estimated breeding values for beef tenderness. BMC MOLECULAR BIOLOGY, v. 20, JAN 3 2019. Citações Web of Science: 1.
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; REECY, JAMES M.; POLETI, MIRELE D.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; DE OLIVEIRA, GABRIELLA B.; MOREIRA, GABRIEL C. M.; MUDADU, MAURICIO A.; TIZIOTO, POLYANA C.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ELYN; KRAMER, LUKE; GARRICK, DORIAN; BEIKI, HAMID; GEISTLINGER, LUDWIG; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI, ADHEMAR; COUTINHO, LUIZ L. Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. BMC Genomics, v. 19, JUN 27 2018. Citações Web of Science: 3.
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; POLETI, MIRELE D.; ANDRADE, SONIA C. S.; TIZIOTO, POLYANA C.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; FELICIO, ANDREZZA M.; DO NASCIMENTO, MICHELE L.; CHAVES, AMALIA S.; LANNA, DANTE P. D.; TULLIO, RYMER R.; NASSU, RENATA T.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ERIC; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI-NETO, ADHEMAR; REECY, JAMES M.; COUTINHO, LUIZ L. Differences in the skeletal muscle transcriptome profile associated with extreme values of fatty acids content. BMC Genomics, v. 17, NOV 22 2016. Citações Web of Science: 8.

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