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Dinâmica molecular de hidrólise enzimática de celulose e outros estudos por QM/MM de reações químicas em sistemas biomoleculares

Processo: 14/12833-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2014
Vigência (Término): 30 de novembro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
Pesquisador responsável:Munir Salomao Skaf
Beneficiário:Raúl Mera Adasme
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID
Assunto(s):Celulase   Receptores citoplasmáticos e nucleares   Bioetanol   Modelagem molecular   Simulação de dinâmica molecular   Teoria do funcional da densidade

Resumo

Neste projeto nós propomos aplicar técnicas modernas de simulação por dinâmica molecular clássica e híbridas quântico-clássicas para estudar proteínas de interesse envolvidas na conversão de biomassa lignocelulósica em açúcares solúveis. O foco primário desta pesquisa são as CBHs e EGs e outras celulases de fungos e bactérias. Nosso interesse específico é explorar a ligação subtrato-proteína em nível atomístico a fim de compreender a hidrólise de polissacarídeos catalizada por tais enzimas. Para tal, nós iremos usar métodos QM/MM (baseados em abordagens ab initio ou DFT). Métodos similares serão empregados no estudo de reações de fosforilação (e possivelmente de acetilação) em receptores nucleares, os quais formam uma importante família de proteínas que se ligam a hormônios e que são responsáveis pela regulação da transcrição de genes específicos envolvidos no desenvolvimento celular e em funções metabólicas. (AU)

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