Dinâmica molecular de hidrólise enzimática de celulose e outros estudos por QM/MM de reações químicas em sistemas biomoleculares

• Processo: 14/12833-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2014
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Munir Salomao Skaf
• Beneficiário: Raúl Mera Adasme
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID
• Assunto(s): Celulase Receptores citoplasmáticos e nucleares Bioetanol Modelagem molecular Simulação de dinâmica molecular Teoria do funcional da densidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioetanol | Celulases | Dinâmica Molecular | Mm | Modelagem molecular | Receptores nucleares | Simulações DFT QM | Química teórica computacional

Resumo

Neste projeto nós propomos aplicar técnicas modernas de simulação por dinâmica molecular clássica e híbridas quântico-clássicas para estudar proteínas de interesse envolvidas na conversão de biomassa lignocelulósica em açúcares solúveis. O foco primário desta pesquisa são as CBHs e EGs e outras celulases de fungos e bactérias. Nosso interesse específico é explorar a ligação subtrato-proteína em nível atomístico a fim de compreender a hidrólise de polissacarídeos catalizada por tais enzimas. Para tal, nós iremos usar métodos QM/MM (baseados em abordagens ab initio ou DFT). Métodos similares serão empregados no estudo de reações de fosforilação (e possivelmente de acetilação) em receptores nucleares, os quais formam uma importante família de proteínas que se ligam a hormônios e que são responsáveis pela regulação da transcrição de genes específicos envolvidos no desenvolvimento celular e em funções metabólicas. (AU)