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Estudo da RNA helicase da família DEAD-box codificada pelo gene CC0835 em Caulobacter crescentus

Processo: 14/13552-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2014
Vigência (Término): 30 de setembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
Convênio/Acordo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Marilis Do Valle Marques
Beneficiário:Alexandre Magno Vicente
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/04046-8 - Sistemas regulatórios da resposta bacteriana a estresses, AP.TEM
Assunto(s):Regulação da expressão gênica   RNA helicases   Caulobacter crescentus

Resumo

Caulobacter crescentus é uma bactéria gram-negativa não patogênica e de vida livre, presente principalmente em ambientes aquáticos, e tem sido utilizado como um importante sistema modelo para o estudo do ciclo celular, uma vez que suas células possuem a característica de se dividir em duas células-filhas distintas. Seu ciclo de vida complexo aliado a forma de controle gênico desenvolvido pela espécie para adaptar-se às condições ambientais, a tornam um modelo excelente para estudos de genes relacionados a mecanismos de respostas a estresses ambientais. Em baixas temperaturas, é energeticamente favorável a formação de estruturas secundárias no RNA, comprometendo gravemente suas funções e, consequentemente, os processos celulares em que participa. Neste momento é essencial a expressão de proteínas especializadas, como proteínas de choque frio, helicases e chaperones de RNA, que ajudam a ajustar a célula à nova condição ambiental. A RNA helicase da família DEAD-box codificada pelo gene CC0835 merece atenção, uma vez que mutantes apresentam fitness reduzido a 30°C e alta sensibilidade ao frio, sugerindo um papel celular importante, e ainda desconhecido. Este projeto propõe construir uma linhagem onde a proteína será adicionada de um epitopo reconhecido por anticorpo comercial, e que permitirá estudar sua expressão durante o ciclo celular e em diferentes condições ambientais. Também sua interação com RNAs específicos será investigada através de co-imunoprecipitação e identificação dos RNAs por sequenciamento em larga escala (High-Throughput Sequencing of RNA isolated by Cross-Linking Immunoprecipitation (HITS-CLIP). Assim, a compreensão dos sinais regulatórios de sua expressão e de sua interação com RNAs permitirá a elucidação de seu papel celular. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ASSIS, NADINE G.; RIBEIRO, RODOLFO A.; DA SILVA, LARISSA G.; VICENTE, ALEXANDRE M.; HUG, ISABELLE; MARQUES, MARILIS V. Identification of Hfq-binding RNAs in Caulobacter crescentus. RNA BIOLOGY, v. 16, n. 6 MAR 2019. Citações Web of Science: 0.
AGUIRRE, ANGEL A.; VICENTE, ALEXANDRE M.; HARDWICK, STEVEN W.; ALVELOS, DANIELA M.; MAZZON, RICARDO R.; LUISI, BEN F.; MARQUES, MARILIS V. Association of the Cold Shock DEAD-Box RNA Helicase RhlE to the RNA Degradosome in Caulobacter crescentus. Journal of Bacteriology, v. 199, n. 13 JUL 2017. Citações Web of Science: 6.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
VICENTE, Alexandre Magno. Estudo da RNA helicase DEAD-box codificada pelo gene CC0835 em Caulobacter crescentus.. 2017. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas São Paulo.

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