Análise de parentesco e variabilidade genética de pacu (Piaractus mesopotamicus) por meio de marcadores SNPs: subsídios para o melhoramento genético

• Processo: 14/12412-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2014
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Diogo Teruo Hashimoto
• Beneficiário: Vito Antonio Mastrochirico Filho
• Instituição Sede: Centro de Aquicultura (CAUNESP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Assunto(s): Piscicultura Pacu Piaractus mesopotamicus Marcador molecular Melhoramento genético Sequenciamento de nova geração Transcriptoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Manejo Genético | marcador molecular | Piscicultura | RNA-seq | sequenciamento de nova geração | Transcriptoma | Genética

Resumo

Com o crescente aumento de espécies de peixes sobre exploradas pela pesca, e profundas alterações dos seus ambientes naturais, o desenvolvimento de uma exploração correta dos recursos da aquicultura certamente poderá auxiliar a suprir a demanda de proteína animal. Programas de melhoramento genético podem garantir a maximização do desempenho produtivo nos sistemas de cultivo, pois são capazes de otimizar o rendimento da produção da espécie-alvo. Entretanto, é fundamental que se realize primeiramente estudos de variabilidade genética por meio de marcadores moleculares, de maneira a evitar o gargalo genético e depressão endogâmica. Para esta finalidade, SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) são considerados os marcadores moleculares mais apropriados, uma vez que constituem o polimorfismo mais abundante em qualquer organismo. O pacu (Piaractus mesopotamicus) é considerado uma das espécies de peixe de maior valor comercial e de potencial para a piscicultura nacional, portanto, uma espécie-alvo para programas de melhoramento genético. O presente trabalho tem como objetivo analisar o grau de parentesco e variabilidade genética de estoques de pacu utilizando marcadores SNPs obtidos por sequenciamento de nova geração. Será realizada a caracterização do transcriptoma de fígado de cerca de 20 exemplares provenientes de diferentes pisciculturas do Brasil e ambientes naturais. Para a validação dos SNPs, as análises serão realizadas em aproximadamente 30 indivíduos coletados em ambiente natural. Por fim, com o estabelecimento dos SNPs, pretende-se analisar estoques cultivados de reprodutores de pacu em pisciculturas brasileiras (aproximadamente 200 amostras), como forma de conhecer o perfil genético destes animais e melhorar o manejo genético nos sistemas de produção. Estudos genéticos enfocando um maior conhecimento do genoma dos estoques cultivados de pacu são considerados essenciais para aquicultura, principalmente no sentido de fornecer subsídios para o desenvolvimento de programas de manejo e melhoramento desta espécie. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MASTROCHIRICO-FILHO, VITO ANTONIO; HATA, MILENE ELISSA; SATO, LUCAS SEITI; JORGE, PAULO HENRIQUE; FORESTI, FAUSTO; RODRIGUEZ, MANUEL VERA; MARTINEZ, PAULINO; PORTO-FORESTI, FABIO; HASHIMOTO, DIOGO TERUO. SNP discovery from liver transcriptome in the fish Piaractus mesopotamicus. CONSERVATION GENETICS RESOURCES, v. 8, n. 2, p. 109-114, JUN 2016. (14/03772-7, 14/12412-4)

ANTONIO MASTROCHIRICO-FILHO, VITO; DEL PAZO, FELIPE; ELISSA HATA, MILENE; VANINA VILLANOVA, GABRIELA; FORESTI, FAUSTO; VERA, MANUEL; MARTINEZ, PAULINO; PORTO-FORESTI, FABIO; TERUO HASHIMOTO, DIOGO. Assessing Genetic Diversity for a Pre-Breeding Program in Piaractus mesopotamicus by SNPs and SSRs. GENES, v. 10, n. 9, SEP 2019. (14/03772-7, 14/12412-4)

HASHIMOTO, D. T.; HATA, M. E.; SATO, L. S.; JORGE, P. H.; MASTROCHIRICO-FILHO, V. A.; MARTINEZ, P.; FORESTI, F.; PORTO-FORESTI, F.. TRANSCRIPTOME CHARACTERIZATION AND SNP DISCOVERY IN SPECIES OF SERRASALMIDAE: GENETIC SUBSIDIES FOR THE BRAZILIAN AQUACULTURE. Aquaculture, v. 472, p. 1-pg., 2017-04-01. (14/05732-2, 14/12412-4, 14/03772-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MASTROCHIRICO FILHO, Vito Antonio. Análise de parentesco e variabilidade genética de pacu (Piaractus mesopotamicus) por meio de marcadores SNPs: subsídios para o melhoramento genético. 2016. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal Jaboticabal.