Investigação do transcriptoma e do proteoma salivar e plasmático em indivíduos acometidos por diabetes mellitus tipo 2, dislipidemia e doença periodontal crônica

• Processo: 14/16148-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de janeiro de 2015
• Vigência (Término): 31 de dezembro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Odontologia - Periodontia
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Raquel Mantuaneli Scarel Caminaga
• Beneficiário: Sâmia Cruz Tfaile Corbi
• Instituição Sede: Faculdade de Odontologia (FOAr). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/08678-1 - Investigação do proteoma salivar e plasmático em indivíduos acometidos por diabetes mellitus tipo 2, dislipidemia e doença periodontal crônica, BE.EP.PD
• Assunto(s): Diabetes mellitus tipo 2 Doenças periodontais Mediadores da inflamação Polimorfismo genético Proteínas e peptídeos salivares Dislipidemias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diabetes Mellitus tipo 2 | dislipidemias | Doenças Periodontais | Mediadores da inflamação | Polimorfismo genético | Proteínas e Peptídeos Salivares | Genética

Resumo

O objetivo deste projeto de pesquisa é realizar análises complementares do transcriptoma (estudo 1) e investigar o proteoma salivar e plasmático (estudo 2) de indivíduos acometidos por Diabetes Mellitus tipo 2 (DM2, compensados/descompensados metabolicamente), Dislipidemia e Doença Periodontal Crônica (DP). O desenvolvimento do estudo 1 visa complementar o recém-concluído Doutorado da solicitante (Bolsa Doutorado FAPESP 2009/16233-9, e Auxílio Pesquisa FAPESP 2010/10882-2) em que foram investigados 5 grupos de pacientes (com 30 pacientes cada): Grupo 1- Indivíduos acometidos por DM2, descompensados metabolicamente (HbA1c e 8,0%), com dislipidemia e com DP; Grupo 2- Indivíduos com DM2, compensados metabolicamente (HbA1c < 8,0%), com dislipidemia e com DP; Grupo 3- Indivíduos sem DM2, com dislipidemia e com DP; Grupo 4- Indivíduos sem DM2, sem dislipidemia e com DP; Grupo 5- Indivíduos sem DM2, sem dislipidemia e sem DP. No Doutorado os dados dos microarrays foram analisados das seguintes formas: Grupo 1 + Grupo 2 vs Grupo 3; Grupo 1 vs Grupo 2; Grupo 1 vs Grupo 3, Grupo 2 vs Grupo 3; Grupo 3 vs Grupo 4; Grupo 4 vs Grupo 5. Para complementar dos resultados do transcriptoma, neste estudo 1 propomos realizar análises de Bioinformática e Bioestatística semelhantemente às comparações acima, só que considerando como controle sempre o grupo 5; da seguinte maneira: Grupo 1 + Grupo 2 vs Grupo 5; Grupo 1 vs Grupo 5; Grupo 2 vs Grupo 5; Grupo 3 vs Grupo 5. Serão selecionados nas mencionadas comparações de grupos, 2 a 3 genes diferencialmente expressos (hipo/ hiperexpressos) e que podem ter algum papel na fisiopatologia das alterações analisadas para serem validados por RT-qPCR (Transcriptase-Reversa seguida de Reação em Cadeia da Polimerase quantitativo em Tempo Real). No estudo 2 será investigado o proteoma salivar e plasmático de cada um dos citados grupos de indivíduos para identificação, caracterização e quantificação das proteínas mais/menos abundantes na saliva. Serão confeccionados géis SDS-PAGE em gradiente de poliacrilamida entre 4 e 20% e também géis PAGE nativos para separação e quantificação das proteínas. Em seguida, será utilizada Cromatografia Líquida por Fase Reversa e Cromatografia Líquida Tandem Espectrometria de Massas. Serão selecionadas uma proteína com maior abundância e outra com menor abundância em cada grupo Grupo 1, Grupo 2, Grupo 3 e Grupo 4 em comparação ao grupo controle Grupo 5 para validação por ELISA ou Western Blotting. É importante realizar este presente estudo, pois os genes e/ou proteínas diferencialmente expressos em cada condição, após validados, poderão ser investigados como novos alvos terapêuticos, além de serem úteis para o diagnóstico e acompanhamento clínico dos pacientes acometidos por essas patologias. Além disso, também se espera contribuir para a elucidação dos mecanismos moleculares envolvidos nessas doenças. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VERONEZE, ROSANA; CRUZ TFAILE CORBI, SAMIA; ROQUE DA SILVA, BARBARA; DE S. ROCHA, CRISTIANE; V. MAURER-MORELLI, CLAUDIA; PEREZ ORRICO, SILVANA REGINA; CIRELLI, JONI A.; VON ZUBEN, FERNANDO J.; MANTUANELI SCAREL-CAMINAGA, RAQUEL. Using association rule mining to jointly detect clinical features and differentially expressed genes related to chronic inflammatory diseases. PLoS One, v. 15, n. 10, p. 22-pg., 2020-10-02. (16/25418-6, 09/16233-9, 10/10882-2, 17/21174-8, 14/16148-0, 07/08362-8)

CORBI, SAMIA C. T.; DE VASCONCELLOS, JAIRA F.; BASTOS, ALLINY S.; BUSSANELI, DIEGO GIROTTO; DA SILVA, BARBARA ROQUE; SANTOS, RAQUEL ALVES; TAKAHASHI, CATARINA S.; ROCHA, CRISTIANE DE S.; CARVALHO, BENILTON DE SA; MAURER-MORELLI, V, CLAUDIA; et al. Circulating lymphocytes and monocytes transcriptomic analysis of patients with type 2 diabetes mellitus, dyslipidemia and periodontitis. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, MAY 18 2020. (07/08362-8, 14/16148-0, 10/10882-2, 09/16233-9)