| Processo: | 14/26369-3 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de maio de 2015 |
| Data de Término da vigência: | 30 de abril de 2016 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular |
| Pesquisador responsável: | Fabio de Lima Leite |
| Beneficiário: | Guedmiller Souza de Oliveira |
| Supervisor: | James M. Briggs |
| Instituição Sede: | Centro de Ciências e Tecnologias para a Sustentabilidade (CCTS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | University of Houston (UH), Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 13/09746-5 - Desenvolvimento de nanobiossensores utilizando técnicas computacionais avançadas, BP.PD |
| Assunto(s): | Microscopia de força atômica Simulação de dinâmica molecular Simulação por computador Nanobiotecnologia Triagem Enzimas |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | atomic force microscope | charge distribution | computer programming | electrostatic potential | molecular dynamics simulation | molecular orientation | Simulação computacional de processos biológicos |
Resumo As medições feitas com o microscópio de força atômica (MFA) para o reconhecimento molecular baseiam-se na interação entre duas moléculas: uma ligada à ponta do MFA e outra ligada à superfície de interesse. A imobilização experimental destes sistemas nos nanocomponentes do MFA é um grande desafio para os pesquisadores em todo o mundo. No entanto, o procedimento experimental pode ser assistido por simulações computacionais que proporcionam uma visão preliminar da interação molecular alvo. O principal objetivo deste projeto é investigar os mecanismos reacionais que acometem doenças neurodegenerativas, incluindo esclerose múltipla e neuromielite óptica. Hipóteses da literatura evidenciam um papel significativo de anticorpos autorreativos no desenvolvimento de doenças neurodegenerativas. Neste contexto, a imobilização de anticorpos nos nanocomponentes do MFA pode revelar os mecanismos químicos envolvidos na propagação destas doenças. Métodos de simulação computacional avançadas tais como a Modelagem Molecular, Docking Molecular, Dinâmica Molecular e Mecânica Quântica serão aplicados para a determinação da orientação molecular, energia de interação e da interação entre antígenos e anticorpos na ponta do MFA e superfície da amostra respectivamente. As interações eletrostáticas desempenham um papel importante na imobilização biomolecular (adsorção). Estas interações poderão ser calculadas em colaboração com o pesquisador Prof. Dr. James M. Briggs do Departamento de Biologia e Bioquímica da Universidade de Houston (TX, EUA) por intermédio do programa University of Houston Brownian Dynamics (UHBD). Este fornece resultados sobre a distribuição de carga e potencial eletrostático por meio da resolução numérica da equação de Poisson-Boltzmann usando o método de diferenças finitas. Ademais, dados advindos das simulações por dinâmica Browniana, utilizando o mesmo programa irão propiciar a estimativa da orientação de biomoléculas e da dinâmica interna da interação antígeno-anticorpo. (AU) | |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa: | |
| Mais itensMenos itens | |
| TITULO | |
| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ): | |
| Mais itensMenos itens | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |