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Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características reprodutivas de novilhas da raça Nelore

Processo: 14/26354-6
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 24 de abril de 2015
Vigência (Término): 23 de abril de 2016
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Reprodução Animal
Pesquisador responsável:José Bento Sterman Ferraz
Beneficiário:Gerson Antônio de Oliveira Júnior
Supervisor no Exterior: Dorian J. Garrick
Instituição-sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
Local de pesquisa : Iowa State University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:13/12097-9 - Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características reprodutivas de novilhas da raça Nelore, BP.DR
Assunto(s):Genética   Genômica

Resumo

Características reprodutivas são de extrema importância dentro do sistema de produção pecuária, por influenciarem a quantidade de animais que serão destinados ao mercado e o intervalo de gerações da população, além do ganho genético/ano. No entanto, identificar esses animais mais precoces é, geralmente, um processo complicado, dado a complexidade que envolve essas características. Os avanços alcançados na área da genômica nos últimos anos possibilitam, hoje, estudos de identificação e caracterização de genes ou marcadores de genes que influenciam características poligênicas nos animais domésticos. A identificação de marcadores do tipo SNP, que apresentem associação importante com características reprodutivas traria importante contribuição para a seleção das mesmas. O objetivo do trabalho será desenvolver estudos de associação genômica ampla (GWAS) e Seleção Genômica em características relacionadas com a precocidade sexual de fêmeas da raça Nelore. O experimento será conduzido junto ao Núcleo de Pesquisa em Melhoramento Animal, Biotecnologia e Transgênese (GMAB) da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da Universidade de São Paulo (FZEA/USP). O banco de dados será formado por 2.000 fêmeas da raça Nelore de seis diferentes populações. As análises de GWAS serão realizadas com auxílio das ferramentas bioestatísticas PLINK, GenSel e BLUPF90, sendo que os efeitos de substituição alélica serão preditos por diferentes métodos estatísticos (GBLUP, Bayes A, B, C, CÀ, R, LASSO), visando verificar o método de melhor ajuste aos dados. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; PEREZ, B. C.; COLE, J. B.; SANTANA, M. H. A.; SILVEIRA, J.; MAZZONI, G.; VENTURA, R. V.; SANTANA JUNIOR, M. L.; KADARMIDEEN, H. N.; GARRICK, D. J.; FERRAZ, J. B. S. Genomic study and Medical Subject Headings enrichment analysis of early pregnancy rate and antral follicle numbers in Nelore heifers. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 95, n. 11, p. 4796-4812, NOV 2017. Citações Web of Science: 9.

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