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Análise genômica em larga escala aplicadas à biologia de Cromossomos B

Processo: 14/16477-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2015
Vigência (Término): 04 de setembro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:Syed Farhan Ahmad
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/03877-4 - Exploração de dados de sequenciamento de nova geração para descobrir o conteúdo genômico e origem dos cromossomos B., BE.EP.DR
Assunto(s):Citogenética   Genômica   Cromossomos B   Evolução molecular

Resumo

Aproximadamente 15% dos eucariotos possuem cromossomos B, que quando presentes representam até 5% do genoma. Embora milhares de trabalhos descrevem a distribuição de supranumerários em diversos taxa, uma teoria compreensiva da origem, manutenção e evolução dos cromossomos B não surgiu até o momento. Assim, no presente trabalho propomos o sequenciamento de genomas completos com e sem cromossomos B de diferentes espécies (a planta Cestrum intermedium, o besouro Dichotomius geminatus e o peixe Astyanax mexicanus) com o foco na identificação de sequências do B. Sequências identificadas no B serão analisadas ainda por reação em cadeia da polimerase em tempo real e hibridização in situ. O desenvolvimento da presente proposta de pesquisa permitirá a identificação de genes presentes no B das diferentes espécies e seu possível papel biológico. Além disso, será possível testar a hipótese que genes envolvidos com ciclo celular tendem a acumular independentemente no cromossomo B de diferente organismos. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AHMAD, SYED F.; JEHANGIR, MARYAM; CARDOSO, ADAUTO L.; WOLF, IVAN R.; MARGARIDO, VLADIMIR P.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; O'NEILL, RACHEL; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. B chromosomes of multiple species have intense evolutionary dynamics and accumulated genes related to important biological processes. BMC Genomics, v. 21, n. 1 SEP 23 2020. Citações Web of Science: 0.
AHMAD, SYED FARHAN; MARTINS, CESAR. The Modern View of B Chromosomes Under the Impact of High Scale Omics Analyses. CELLS, v. 8, n. 2 FEB 2019. Citações Web of Science: 5.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
AHMAD, Syed Farhan. High Scale Genomic Applied to B chromosome biology. 2019. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu)..

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