Metagenômica como ferramenta para acessar uma diversidade química de zonas de ecótono entre Mata Atlântica e Cerrado

• Processo: 14/22877-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2015
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química
• Pesquisador responsável: Mônica Tallarico Pupo
• Beneficiário: Ulysses Amancio de Frias
• Supervisor: Sean F. Brady
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Rockefeller University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 12/16139-5 - Busca de produtos naturais microbianos utilizando a metagenômica, BP.DD
• Assunto(s): Química de produtos naturais Produtos naturais Metagenoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Metagenome | Natural Products | Next Generation Sequencing | Química de Produtos Naturais

Resumo

Mata Atlântica e Cerrado são dois dos mais biodiversos biomas no Brasil e representam uma potencial e inexplorada fonte microbiana. Tentando entender os aspectos de vida dos micro-organismos nestes biomas, amostras de solo serão coletadas em zonas de ecotóne entre estes biomas no Parque Estadual do Vassununga (Brasil) e os metagenomas serão obtidos através do isolamento do DNA ambiental. Os amplicons para domínios de policetídeos e peptídeos não-ribossomais serão obtidos por PCR utilizando primers e os metagenomas serão sequenciados por 454-NGS. Os dados serão processados e analisados através de diversas ferramentas de bioinformática. Através da transfecção das bibliotecas metagenômicas, as amostras pré-selecionadas passarão por um processo de triagem selecionando clones bioativos que serão submetidos ao processo de isolamentos dos compostos químicos relacionados às atividades biológicas nestes microbiomas. (AU)