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Metagenômica como ferramenta para acessar uma diversidade química de zonas de ecótono entre Mata Atlântica e Cerrado

Processo: 14/22877-4
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de maio de 2015
Vigência (Término): 30 de abril de 2016
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química
Pesquisador responsável:Mônica Tallarico Pupo
Beneficiário:Ulysses Amancio de Frias
Supervisor no Exterior: Sean F. Brady
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Local de pesquisa : Rockefeller University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:12/16139-5 - Busca de produtos naturais microbianos utilizando a metagenômica, BP.DD
Assunto(s):Química de produtos naturais   Produtos naturais   Metagenoma

Resumo

Mata Atlântica e Cerrado são dois dos mais biodiversos biomas no Brasil e representam uma potencial e inexplorada fonte microbiana. Tentando entender os aspectos de vida dos micro-organismos nestes biomas, amostras de solo serão coletadas em zonas de ecotóne entre estes biomas no Parque Estadual do Vassununga (Brasil) e os metagenomas serão obtidos através do isolamento do DNA ambiental. Os amplicons para domínios de policetídeos e peptídeos não-ribossomais serão obtidos por PCR utilizando primers e os metagenomas serão sequenciados por 454-NGS. Os dados serão processados e analisados através de diversas ferramentas de bioinformática. Através da transfecção das bibliotecas metagenômicas, as amostras pré-selecionadas passarão por um processo de triagem selecionando clones bioativos que serão submetidos ao processo de isolamentos dos compostos químicos relacionados às atividades biológicas nestes microbiomas. (AU)