Análise de alterações induzidas por fator de crescimento no proteoma nuclear ao longo do ciclo celular de células tumorais de camundongo

• Processo: 15/04867-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica
• Pesquisador responsável: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
• Beneficiário: Mariana de Camargo Lopes
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/22619-7 - Alterações nucleares e na cromatina ao longo do ciclo celular e senescência de células de mamíferos, AP.JP
• Assunto(s): Proteômica Proteoma Ciclo celular Células tumorais Cromatina Camundongos Espectrometria de massas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ciclo celular | cromatina | Espectrometria de massas | Fgf | histona | núcleo | proteomica

Resumo

O núcleo contém proteínas essenciais para a manutenção e regulação do genoma transformando sinais extracelulares e intracelulares em alterações da expressão gênica e alterações fenotípicas. Neste projeto pretendemos realizar, em larga escala, análises comparativas e quantitativas do proteoma nuclear em diferentes fases do ciclo celular e na senescência de células tumorais de camundongo estimuladas com FGF2. Para tal, os extratos nucleares serão analisados sistematicamente por espectrometria de massas, o que permitirá investigar em maiores detalhes, proteínas intimamente relacionadas no gerenciamento da expressão gênica, do fenótipo celular, na mediação da replicação celular, no remodelamento da cromatina e no reparo e dano do DNA. Para as análises quantitativas, utilizaremos duas abordagens: Spike-in SILAC e quantificação do tipo label free. A partir de uma intensa análise por bionformática, integrando os dados aqui obtidos com dados da literatura, dados de vias de sinalização e demais informações públicas, acreditamos ser possível identificar moléculas-chave responsáveis pela indução e manutenção dos bloqueios no ciclo celular e na senescência induzidas por FGF2, além de permitir o melhor entendimento da biologia do ciclo celular e biologia tumoral. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LUND, PEDER J.; LOPES, MARIANA; SIDOLI, SIMONE; CORADIN, MARIEL; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA NATHALIA; CHAGAS DA CUNHA, JULIA PINHEIRO; GARCIA, BENJAMIN A.. FGF-2 induces a failure of cell cycle progression in cells harboring amplified K-Ras, revealing new insights into oncogene-induced senescence. MOLECULAR OMICS, v. 17, n. 5, p. 725-739, OCT 11 2021. (16/24881-4, 15/04867-4, 13/07467-1, 17/15835-1, 18/15553-9, 11/22619-7, 17/18344-9)

LUND, PEDER J.; LOPES, MARIANA; SIDOLI, SIMONE; CORADIN, MARIEL; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA NATHALIA; CHAGAS DA CUNHA, JULIA PINHEIRO; GARCIA, BENJAMIN A.. FGF-2 induces a failure of cell cycle progression in cells harboring amplified K-Ras, revealing new insights into oncogene-induced senescence. MOLECULAR OMICS, JUN 2021. (11/22619-7, 16/24881-4, 17/15835-1, 18/15553-9, 15/04867-4, 17/18344-9, 13/07467-1)

LEANDRO DE JESUS, TERESA CRISTINA; NUNES, VINICIUS SANTANA; LOPES, MARIANA DE CAMARGO; MARTIL, DAIANA EVELIN; IWAI, LEO KEI; MORETTI, NILMAR SILVIO; MACHADO, FABRICIO CASTRO; DE LIMA-STEIN, MARIANA L.; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE; ELIAS, MARIA CAROLINA; et al. Chromatin Proteomics Reveals Variable Histone Modifications during the Life Cycle of Trypanosoma cruzi. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 15, n. 6, p. 2039-2051, JUN 2016. (13/07467-1, 14/03714-7, 08/57910-0, 12/09403-8, 15/04867-4, 11/06087-5, 11/51973-3, 11/22619-7, 14/01577-2)