Caracterização funcional de Nop53/PICT1: modulação da biogênese ribossomal, atividade do exossomo, e efeito sobre o ciclo celular

• Processo: 15/05776-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2015
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Carla Columbano de Oliveira
• Beneficiário: Felipe Franco de Melo Bagatelli
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 10/51842-3 - SMOLBNET2: estudo de estrutura de proteínas componentes e reguladoras do exossomo de Archaea e de levedura, AP.TEM
• Assunto(s): Regulação da expressão gênica Exossomos Ribossomos Proteínas nucleares Saccharomyces cerevisiae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biogênese ribossomal | exossomo | Nop53 | Rrp6 | Regulação da Expressão Gênica

Resumo

Os ribossomos são complexos ribonucleoproteicos altamente conservados responsáveis pela tradução dos RNAs mensageiros (mRNA), catalisando no citoplasma a síntese proteica. Em eucariotos, são constituídos pelas subunidades 40S e 60S, sendo a primeira composta pelo RNA ribossomal (rRNA) 18S e 33 proteínas ribossomais, enquanto a partícula 60S é constituída pela associação dos rRNAs 25S, 5.8S e 5S com 46 proteínas ribossomais. A biogênese destes complexos tem origem no nucléolo e constitui um processo energeticamente dispendioso, altamente orquestrado, com diversas etapas, nas quais cerca de 200 proteínas não ribossomais e 76 RNAs não codificadores participam. Apesar dos recentes avanços na descrição de novos fatores de montagem, na descoberta dos mecanismos de processamento do rRNA, e na caracterização estrutural das subunidades em diferentes estágios de maturação, a função específica desempenhada pelas diversas proteínas não ribossomais na formação e maturação das subunidades pré-40S e pré-60S ainda permanece por ser elucidada. Nop53, uma proteína nucleolar essencial em Saccharomyces cerevisiae, afeta etapas tardias da maturação da subunidade pré-60S e interage com fatores de processamento do rRNA, dentre os quais a subunidade catalítica do exossomo, Rrp6, e com o rRNA 5.8S, processado pelo exossomo. A proteína humana PICT1 (GTSCR2), ortóloga de Nop53 também foi encontrada na subunidade pré-60S e descrita como sendo um supressor de tumor. Apesar dos avanços na descrição de Nop53 e de PICT1, seu papel na biogênese da subunidade ribossomal maior, bem como sua influência sobre a atividade exonucleolítica do exossomo ainda permanecem pouco compreendidos. Este projeto tem por principal objetivo a caracterização funcional da proteína nucleolar Nop53 em S. cerevisiae elucidando seu papel na biogênese ribossomal, no ciclo celular e na modulação da atividade do exossomo eucariótico, verificando-se os mecanismos pelos quais ela afeta o nível de expressão de Rrp6. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CEPEDA, LEIDY PAOLA P.; BAGATELLI, FELIPE F. M.; SANTOS, RENATA M.; SANTOS, MARLON D. M.; NOGUEIRA, FABIO C. S.; OLIVEIRA, CARLA C.. The ribosome assembly factor Nop53 controls association of the RNA exosome with pre-60S particles in yeast. Journal of Biological Chemistry, v. 294, n. 50, p. 19365+, DEC 13 2019. (15/06477-9, 15/05776-2)

BAGATELLI, FELIPE F. M.; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA N.; DA CUNHA, JULIA P. C.; OLIVEIRA, CARLA C.. The ribosome assembly factor Nop53 has a structural role in the formation of nuclear pre-60S intermediates, affecting late maturation events. Nucleic Acids Research, v. 49, n. 12, p. 7053-7074, JUL 9 2021. (15/05776-2, 15/06477-9, 13/07467-1)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

BAGATELLI, Felipe Franco de Melo. Caracterização do papel de Nop53 na montagem da subunidade ribossomal maior em Saccharomyces cerevisiae. 2021. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.