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Identificação e avaliação da expressão de microRNAs reguladores da deposição de gordura intramuscular em bovinos da raça Nelore

Processo: 15/00617-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2015
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Convênio/Acordo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Luiz Lehmann Coutinho
Beneficiário:Gabriella Borba de Oliveira
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:12/23638-8 - Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore, AP.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):15/24688-7 - Análise de co-expressão de microRNAs diferencialmente expressos e genes alvos envolvidos em mecanismos moleculares de deposição de gordura intramuscular, BE.EP.MS
Assunto(s):Biotecnologia   Expressão gênica   MicroRNAs   Bovinos

Resumo

O Brasil ocupa a segunda posição mundial na produção de carne bovina e a expansão das exportações está ligada à implantação de novas ferramentas para buscar a seleção de animais zebuínos (Bos taurus indicus) que correspondem a aproximadamente 80% desse patrimônio. A quantidade de gordura intramuscular pode influenciar as características sensoriais e o valor nutricional da carne bovina, dessa forma a seleção de animais com teor de gordura adequado para o consumidor se torna importante. Esta característica se mostra complexa pela difícil mensuração, sendo necessário aprofundar o conhecimento de vias gênicas e reguladores que a controlam. Com o advento das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS), atualmente, é possível estudar o genoma e transcriptoma em larga escala, de forma mais rápida e barata. O presente projeto tem como objetivo principal identificar microRNAs conhecidos e novos, bem como as mudanças de expressão dessas moléculas, que estão associadas a deposição de gordura intramuscular em amostras de músculo de bovinos da raça Nelore. Serão utilizados animais de uma população gerada do projeto temático "Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade" da Embrapa. Amostras de tecido muscular já foram coletadas e os fenótipos mensurados. O RNA total de 30 animais com valores genômicos estimados (GEBV) extremos para deposição de gordura intramuscular foi extraído, bibliotecas de microRNA dessas amostras serão construídas e sequenciadas utilizando tecnologia de NGS da Illumina. Por fim, ferramentas de bioinformática e estatística serão usadas para identificação de novos microRNAs e analise da expressão diferencial entre animais com alto e baixo GEBV para quantidade de gordura intramuscular. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OLIVEIRA, GABRIELLA B.; REGITANO, LUCIANA C. A.; CESAR, ALINE S. M.; REECY, JAMES M.; DEGAKI, KARINA Y.; POLETI, MIRELE D.; FELICIO, ANDREZZA M.; KOLTES, JAMES E.; COUTINHO, LUIZ L. Integrative analysis of microRNAs and mRNAs revealed regulation of composition and metabolism in Nelore cattle. BMC Genomics, v. 19, FEB 7 2018. Citações Web of Science: 7.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
OLIVEIRA, Gabriella Borba de. Análise de integração de dados de microRNAs e mRNAs envolvidos na regulação da deposição de gordura intramuscular em bovinos Nelore. 2017. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Piracicaba.

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