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Filogeografia comparada de três complexos de espécies de aves restritas a ambientes de várzea: abordando novos padrões biogeográficos para a Amazônia

Processo: 15/12551-7
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 20 de maio de 2016
Vigência (Término): 19 de maio de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Cristina Yumi Miyaki
Beneficiário:Gregory Thom e Silva
Supervisor no Exterior: Michael Hickerson
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa : City University of New York, New York (CUNY), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:14/00113-2 - Filogeografia comparada de quatro complexos de espécies de aves amazônicas: reconstruindo processos biogeográficos a partir do sequenciamento de elementos ultra conservados, BP.DR
Assunto(s):Filogeografia   Biodiversidade   Fauna   Aves

Resumo

Várias hipóteses biogeográficas foram propostas para explicar a elevada diversidade da fauna Amazônica. Contudo, a complexidade e similaridade entre os padrões genéticos esperados para cada cenário não permite que estas hipóteses sejam adequadamente testadas ou distinguidas a partir de métodos baseados em verossimilhança. A Computação Bayesiana Aproximada (ABC) associada a genética de populações tem se mostrado um método robusto no teste de hipóteses a priori em filogeografia estatística, podendo contribuir para um melhor entendimento dos padrões e processos que afetaram a biogeografia da Amazônia. Apesar do crescente numero de estudos filogeográficos utilizando vertebrados terrestres como modelos, a aplicação de métodos de ABC no teste explicito das hipóteses de diversificação ainda é inexistente. Este estágio de pesquisa no exterior tem como proposta analisar as sequencia de 2560 Elementos Ultra Conservados e de 98 introns com metodologias de ABC que possibilitem o teste de cenários de diversificação em três espécies de Aves restritas as várzeas de rios Amazônicos (Thamnophilus nigrocinereus/cryptoleucus, Myrmoborus lugubris e Myrmotherula assimilis). Os principais objetivos são: 1) Descrever em um contexto temporal e espacial, como foi formado o atual padrão genético dos três complexos de espécie selecionados; 2) testar modelos de diversificação alternativos para cada complexo de espécie; 3) comparar os padrões filogeográficos encontrados, propondo um modelo paleobiogeográfico para espécies de Aves de várzea que abranja o processo de diversificação de cada complexo de espécie selecionado. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DO AMARAL, FABIO RAPOSO; MALDONADO-COELHO, MARCOS; ALEIXO, ALEXANDRE; LUNA, LEILTON W.; DO REGO, PERICLES SENA; ARARIPE, JULIANA; SOUZA, THAINARA O.; SILVA, WEBER A. G.; THOM, GREGORY. Recent chapters of Neotropical history overlooked in phylogeography: Shallow divergence explains phenotype and genotype uncoupling in Antilophia manakins. Molecular Ecology, v. 27, n. 20, p. 4108-4120, OCT 2018. Citações Web of Science: 4.
THOM, GREGORY; DO AMARAL, FABIO RAPOSO; HICKERSON, MICHAEL J.; ALEIXO, ALEXANDRE; ARAUJO-SILVA, LUCAS E.; RIBAS, CAMILA C.; CHOUERI, ERIK; MIYAKI, CRISTINA Y. Phenotypic and Genetic Structure Support Gene Flow Generating Gene Tree Discordances in an Amazonian Floodplain Endemic Species. Systematic Biology, v. 67, n. 4, p. 700-718, JUL 2018. Citações Web of Science: 9.
CHOUERI, ERIK L.; GUBILI, CHRYSOULA; BORGES, SERGIO H.; THOM, GREGORY; SAWAKUCHI, ANDRE O.; SOARES, EMILIO A. A.; RIBAS, CAMILA C. Phylogeography and population dynamics of Antbirds (Thamnophilidae) from Amazonian fluvial islands. Journal of Biogeography, v. 44, n. 10, p. 2284-2294, OCT 2017. Citações Web of Science: 4.

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