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Investigação de perfis microbianos humanos e sua relação com o câncer

Processo: 15/01507-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2015
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2018
Área do conhecimento:Interdisciplinar
Pesquisador responsável:João Carlos Setubal
Beneficiário:Andrew Maltez Thomas
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):16/23527-2 - Identificação de biomarcadores microbianos no câncer colorretal através da caracterização metagenômica a nível de cepa, BE.EP.DR
Assunto(s):Biologia computacional   Radioterapia

Resumo

Na espécie humana, a quantidade de células microbianas é 10 vezes maior que as próprias células humanas. Hoje sabemos que esse nosso metagenoma influencia diversos processos, tais como o metabolismo, o desenvolvimento dos tecidos, a inflamação e imunidade. Certos locais do corpo humano possuem um contato maior com o ambiente externo, tornando o papel que o microbioma possui, mais proeminente. O estudo dos perfis microbianos destes locais pode colaborar com um conhecimento maior sobre sua relação no desenvolvimento de doenças causadas por agentes infeciosos, inclusive o câncer, pois estima-se que eles tenham um papel central em cerca de 20% de todas as neoplasias. Para avaliar a relação bacterioma:câncer iremos: 1) caracterizar a diversidade bacteriana existente em amostras de suco gástrico de indivíduos com lesões pré-neoplásicas (n=30) ou com câncer gástrico (n=40), comparados a indivíduos sem alterações clínicas relevantes (n=30); 2) caracterizar a diversidade bacteriana existente em amostras de biópsias de indivíduos com adenocarcinomas retais (n=18), comparados a biópsias de indivíduos livres de alterações clínicas relevantes (n=18); e 3) avaliar temporalmente a diversidade bacteriana em biópsias de indivíduos com tumores colorretais antes e após radioterapia (n= 40) em 3 intervalos de tempo diferentes, a fim de determinar se perturbações bacterianas possuem uma relação com o desenvolvimento da retite actínica. Para tanto, iremos usar uma abordagem multidisciplinar que irá englobar aspectos de genômica, como o sequenciamento de nova geração do gene 16S rRNA bacteriano, e aspectos avançados de bioinformática para analisar os resultados do sequenciamento. Concomitantemente, iremos minerar bancos de dados públicos usando um pipeline bioinformático afim de investigar a presença de DNA ou RNA bacteriano, buscando validar os achados do sequenciamento de nova geração. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Bactérias do intestino podem ser usadas para prever ocorrência de câncer colorretal 
Estudian la participación de bacterias intestinales en el cáncer del recto 
Estudo investiga envolvimento de bactérias intestinais no câncer de reto 
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (20 total):
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Folha de S. Paulo: Pesquisa que liga micróbios a tumor leva prêmio de oncologia (06/Ago/2019)
Folha.com: Pesquisa que liga micróbios a tumor leva prêmio de oncologia (05/Ago/2019)
Diário do Poder: Atividade física na adolescência pode reduzir risco de câncer colorretal no adulto (24/Mai/2019)
Pesquisas de Química: Bactérias do intestino podem ser usadas para prever ocorrência de câncer colorretal (03/Jan/2020)
Portal da Enfermagem: Pesquisa que liga micróbios a tumor de intestino leva prêmio de oncologia (06/Ago/2019)
Central das Notícias: Pesquisa que liga micróbios a tumor de intestino leva prêmio de oncologia (06/Ago/2019)
Meridional FM: Pesquisa que liga micróbios a tumor de intestino leva prêmio de oncologia (05/Ago/2019)
Eres Viral: Bacterias del intestino pueden utilizarse para prever el cáncer colorrectal (29/Mai/2019)
FolhaMT: Atividade física na adolescência pode reduzir risco de câncer colorretal no adulto (24/Mai/2019)
FolhaPA: Atividade física na adolescência pode reduzir risco de câncer colorretal no adulto (24/Mai/2019)
Folha GO: Atividade física na adolescência pode reduzir risco de câncer colorretal no adulto (24/Mai/2019)
Sindicato dos Comerciários (SP): Atividade física na adolescência pode reduzir risco de câncer colorretal no adulto (24/Mai/2019)
Jornal da USP online: Atividade física na adolescência pode reduzir risco de câncer colorretal no adulto (23/Mai/2019)
Diário da Manhã (RS): Estudo traz novidades para o câncer de intestino (11/Mai/2019)
El Grafico del Sur (República Dominicana): Bacterias del intestino pueden utilizarse para prever el cáncer colorrectal (11/Mai/2019)
NCYT Amazings (Espanha): Bacterias del intestino pueden utilizarse para prever el cáncer colorrectal (09/Mai/2019)
Catalunya Vanguardista (Espanha): Análisis predictivo para el cáncer de colon (09/Mai/2019)
Science and Technology Research News (EUA): Intestinal Bacteria Can Be Used to Predict Occurrence of Colorectal Cancer (26/Abr/2019)
Diário do Rio Doce online: Estudo encontra relação entre bactérias do intestino e câncer colorretal (18/Abr/2019)
Doosar: Bowel bacteria may be associated with colorectal cancer (02/Abr/2019)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AL ASSAL, KARINA; PRIFTI, EDI; BELDA, EUGENI; SALA, PRISCILA; CLEMENT, KARINE; DAO, MARIA-CARLOTA; DORE, JOEL; LEVENEZ, FLORENCE; TADDEI, CARLA R.; FONSECA, DANIELLE CRISTINA; ROCHA, ILANNA MARQUES; BALMANT, BIANCA DEPIERI; THOMAS, ANDREW MALTEZ; SANTO, MARCO A.; DIAS-NETO, EMMANUEL; SETUBAL, JOAO CARLOS; ZUCKER, JEAN-DANIEL; BELARMINO, GILIANE; TORRINHAS, RAQUEL SUSANA; WAITZBERG, DAN L. Gut Microbiota Profile of Obese Diabetic Women Submitted to Roux-en-Y Gastric Bypass and Its Association with Food Intake and Postoperative Diabetes Remission. NUTRIENTS, v. 12, n. 2 FEB 2020. Citações Web of Science: 2.
FACHI, JOSE LUIS; FELIPE, JAQUELINE DE SOUZA; PRAL, LAIS PASSARIELLO; DA SILVA, BRUNA KARADI; CORREA, RENAN OLIVEIRA; PEREIRA DE ANDRADE, MIRELLA CRISTINY; DA FONSECA, DENISE MORAIS; BASSO, PAULO JOSE; SARAIVA CAMARA, NIELS OLSEN; DE SALES E SOUZA, ERICKA LORENNA; MARTINS, FLAVIANO DOS SANTOS; SATO GUIMA, SUZANA EIKO; THOMAS, ANDREW MALTEZ; SETUBAL, JOAO CARLOS; MAGALHAES, YULI THAMIRES; FORTI, FABIO LUIS; CANDREVA, THAMIRIS; RODRIGUES, HOSANA GOMES; DE JESUS, MARCELO BISPO; CONSONNI, SILVIO ROBERTO; FARIAS, ALESSANDRO DOS SANTOS; VARGA-WEISZ, PATRICK; RAMIREZ VINOLO, MARCO AURELIO. Butyrate Protects Mice from Clostridium difficile-Induced Colitis through an HIF-1-Dependent Mechanism. CELL REPORTS, v. 27, n. 3, p. 750+, APR 16 2019. Citações Web of Science: 3.
THOMAS, ANDREW M.; JESUS, ELIANE C.; LOPES, ADEMAR; AGUIAR, JR., SAMUEL; BEGNAMI, MARIA D.; ROCHA, RAFAEL M.; CARPINETTI, PAOLA AVELAR; CAMARGO, ANAMARIA A.; HOFFMANN, CHRISTIAN; FREITAS, HELANO C.; SILVA, ISRAEL T.; NUNES, DIANA N.; SETUBAL, JOAO C.; DIAS-NETO, EMMANUEL. Tissue-Associated Bacterial Alterations in Rectal Carcinoma Patients Revealed by 16S rRNA Community Profiling. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 6, DEC 9 2016. Citações Web of Science: 19.
KINKER, GABRIELA SARTI; THOMAS, ANDREW MALTEZ; CARVALHO, VINICIUS JARDIM; LIMA, FELIPE PRATA; FUJITA, ANDRE. Deletion and low expression of NFKBIA are associated with poor prognosis in lower-grade glioma patients. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, APR 7 2016. Citações Web of Science: 4.

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