Otimização de técnicas de enriquecimento nterminal para análise proteômica em larga escala de amostras complexas

• Processo: 15/18096-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2015
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: André Zelanis Palitot Pereira
• Beneficiário: Isabella Fukushima
• Instituição Sede: Instituto de Ciência e Tecnologia (ICT). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São José dos Campos. São José dos Campos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/06579-3 - Análise sistêmica do processamento N-terminal e diversidade de proteínas no secretoma de células tumorais, AP.JP
• Assunto(s): Espectrometria de massas Processamento de proteína pós-traducional Proteômica Neoplasias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | Espectrometria de massas | Modificações pós-traducionais | N-terminômica | proteômica | Proteômica

Resumo

A investigação sistêmica da extremidade N-terminal de proteínas recebeu recentementea denominação de N-terminomics (N-terminômica) e tem sido fortemente impulsionadapela utilização de plataformas analíticas de alta robustez e processividade, como aespectrometria de massas. A identificação e quantificação simultânea da diversidade deproteínas presentes em amostras biológicas complexas como plasma humano e culturascelulares, bem como de suas modificações N-terminais, tem permitido o entendimentoda compelxidade de importantes processos moleculares em biologia celular. Destaforma, o objetivo deste projeto é introduzir o estudante à cultura de linhagens celulareshumanas, bem como a técnicas de preparação de amostras para análise proteômica delarga escala, com enfoque no N-terminal de peoteínas (N-terminômica).

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LIBERATO, TARCISIO; PESSOTTI, DAYELLE S.; FUKUSHIMA, ISABELLA; KITANO, EDUARDO S.; SERRANO, SOLANGE M. T.; ZELANIS, ANDRE. Signatures of protein expression revealed by secretome analyses of cancer associated fibroblasts and melanoma cell lines. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 174, p. 1-8, MAR 1 2018. (13/07467-1, 15/18096-0, 14/06579-3, 17/07897-7)

AUGUSTO-DE-OLIVEIRA, CESAR; STUGINSKI, DANIEL R.; KITANO, EDUARDO S.; ANDRADE-SILVA, DEBORA; LIBERATO, TARCISIO; FUKUSHIMA, ISABELLA; SERRANO, SOLANGE M. T.; ZELANIS, ANDRE. Dynamic Rearrangement in Snake Venom Gland Proteome: Insights into Bothrops jararaca Intraspecific Venom Variation. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 15, n. 10, p. 3752-3762, OCT 2016. (13/07467-1, 15/18096-0, 14/06579-3)

LIBERATO, TARCISIO; FUKUSHIMA, ISABELLA; KITANO, EDUARDO S.; SERRANO, SOLANGE M. T.; CHAMMAS, ROGER; ZELANIS, ANDRE. Proteomic profiling of the proteolytic events in the secretome of the transformed phenotype of melanocyte-derived cells using Terminal Amine Isotopic Labeling of Substrates. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 192, p. 291-298, FEB 10 2019. (14/06579-3, 15/18096-0, 13/07467-1, 17/07897-7)