Investigação de RNAs não codificadores em Leishmania (Viannia) braziliensis

• Processo: 15/16684-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Natália Melquie Monteiro Teles
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Regulação da expressão gênica Sequenciamento Proteínas Leishmaniose
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Leishmaniose | Proteinas | Regulação da expressão gênica | RNA de interferência (RNAi) | RNAs não codificadores (ncRNAs) | sequenciamento | Parasitologia Molecular de Leishmania

Resumo

As leishmanioses, problema grave de saúde pública, são causadas por protozoários do gênero Leishmania. A plasticidade genética do protozoário e a consequente diferença no padrão de expressão gênica do parasito podem explicar o espectro da patogenicidade observado entre espécies ou linhagens de uma mesma espécie. A análise comparativa dos genomas de Leishmania (Viannia) braziliensis, Leishmania (Leishmania) infantum e Leishmania (L.) major revelou alta conservação sintênica e de sequências codificadoras de proteínas e demonstrou alta divergência das sequências não codificantes. Neste contexto torna-se interessante estudar elementos e mecanismos envolvidos na regulação da expressão gênica, que ocorre no nível pós-transcricional nesses parasitos. Os possíveis papéis de RNAs não codificadores (ncRNAs) nessa regulação, pouco explorados em Leishmania, e a possibilidade da descoberta de mecanismos 'novos' de controle de expressão gênica tornam atrativo seu estudo. Sendo assim, as principais metas desta proposta de pesquisa são caracterizar novos ncRNAs, possivelmente envolvidos na regulação da expressão gênica de L. braziliensis durante o desenvolvimento do parasito. Para isso, depois de identificar o conjunto de transcritos não polissômicos, pela construção e sequenciamento de bibliotecas de RNA dos três principais estágios de vida, empregaremos a genética reversa para investigar o papel e os alvos de ação dos potenciais ncRNAs regulatórios. Um conjunto de ncRNAs identificados será caracterizado funcionalmente pela interferência/diminuição (knockdown) de seus níveis, por RNAi ou por nocaute, e seus alvos e "parceiros" serão investigados por métodos de detecção de RNA e. Com esse trabalho pretendemos contribuir para a compreensão da maquinaria envolvida na regulação da expressão gênica em L. braziliensis.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RUY, PATRICIA DE CASSIA; MONTEIRO-TELES, NATALIA MELQUIE; MISERANI MAGALHAES, RUBENS DANIEL; FREITAS-CASTRO, FELIPE; DIAS, LEANDRO; AQUINO DEFINA, TANIA PAULA; DE VASCONCELOS, ELTON JOSE ROSAS; MYLER, PETER J.; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Comparative transcriptomics in Leishmania braziliensis: disclosing differential gene expression of coding and putative noncoding RNAs across developmental stages. RNA BIOLOGY, v. 16, n. 5, p. 639-660, MAY 4 2019. (13/50219-9, 16/16429-4, 15/16684-1)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

TELES, Natália Melquie Monteiro. Investigação de RNAs não codificadores em Leishmania (Viannia) braziliensis. 2019. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (PCARP/BC) Ribeirão Preto.