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Programação genética para identificação de relacionamentos gene-doença em textos

Processo: 15/21467-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2016
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:Renato Tinós
Beneficiário:Carla Antonieta da Silva Santos Chibante
Instituição-sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Programação genética   Algoritmos evolutivos   Biologia computacional   Inteligência artificial   Algoritmos genéticos   Mineração de texto

Resumo

Como em outras áreas do conhecimento, pesquisadores na área de Biologia Molecular têm relatado suas descobertas principalmente por meio de artigos científicos. Como consequência, o número de artigos publicados que descrevem relacionamentos entre genes e doenças tem crescido exponencialmente nos últimos anos. Este projeto tem como principal objetivo investigar o uso de Programação Genética (PG) para extrair relacionamentos entre genes e doenças a partir de bases de textos científicos. A PG é uma técnica de Computação Evolutiva usada para otimizar estruturas simbólicas. Neste projeto, a PG deve gerar novas regras sintáticas que serão utilizadas para identificar os relacionamentos gene-doença em textos de um corpus. Desta forma, a PG permitirá alterar a forma das regras sintáticas ao longo do processo de otimização. Cada indivíduo da PG codificará um conjunto de regras. Para validar a metodologia proposta, a PG será avaliada em um corpus na qual as palavras e os relacionamentos já se encontram rotulados. (AU)