Quantificação de proteínas diferenciais entre sementes de soja transgênica e não-transgênica usando uma abordagem de contagem de espectros por espectrometria de massas (label free)

• Processo: 15/24668-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de abril de 2016
• Vigência (Término): 31 de julho de 2016
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Analítica
• Pesquisador responsável: Marco Aurelio Zezzi Arruda
• Beneficiário: Bruna Kauely de Campos
• Supervisor: Jay J. Thelen
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Local de pesquisa: University of Missouri, Columbia (UM), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 13/17514-7 - Comparação de Possíveis Alterações Protéicas em Sementes e Plantas de Soja Transgênica e Não-Transgênica Provenientes de Distintas Gerações, BP.DR
• Assunto(s): Métodos bioanalíticos Espectrometria de massas Proteômica Proteínas Organismos geneticamente modificados Soja
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Espectrometria de massas | organismos geneticamente modificados | Proteinas | proteômica | Soja | Transgenicos | bioanalítica

Resumo

A seguinte proposta de Bolsa de Estágio de Pesquisa no Exterior - BEPE está dentro do contexto do meu projeto de doutorado supervisionado pela FAPESP. Aqui estamos propondo a abordagem de quantificação proteômica utilizando tecnologia de alta resolução por espectrometria de massa especificamente com analisador Orbitrap. Esta tecnologia é considerada mundialmente como a melhor para a identificação de proteínas. No Brasil, não existem grupos com a devida expertise para o desenvolvimento de nossa proposta como grupo do prof. Thelen, incluindo a quantificação por contagem de espectros e usando apenas a técnica de espectrometria de massa de alta resolução. Além disso, este grupo tem uma longa experiência com a bioquímica de sementes e plantas, bem como no desenvolvimento de estratégias de gestão de dados com foco em conjuntos de dados em proteômica. Ainda eles oferecem uma combinação de várias plataformas analíticas totalmente suportada pela experiência com bioquímica, bioinformática e bioestatística, que não é encontrada em centros de pesquisa brasileiros em matéria de proteômica de plantas. Assim, é fácil racionalizar que tal proposta complementa o projeto de pesquisa de doutorado desenvolvida por nosso grupo de pesquisa no Brasil, abrangendo um estudo completo do proteoma da semente de soja, bem como comparar a tecnologia utilizada tanto para a quantificação e identificação de proteínas. Adicionalmente, uma diversidade de conceitos de química analítica também pode ser aplicada para melhorar a identificação e quantificação de proteínas, e devido a nossa experiência será certamente focado e aprimorado. (AU)