Efetorômica: efetores como novas ferramentas para o controle de Phytophthora parasitica, agente da gomose e podridão de raízes dos citros.

• Processo: 15/14498-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de janeiro de 2016
• Vigência (Término): 31 de dezembro de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Marcos Antonio Machado
• Beneficiário: Ronaldo José Durigan Dalio
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/57909-2 - Plataforma genômica aplicada ao melhoramento de citros, AP.TEM
• Assunto(s): Genomas Interação planta-patógeno Efetores
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Efetores | Ensaios biológicos para efetores | Genomas | Gomose de Phytophthora | Resistência a gomose | Interação planta-patógeno

Resumo

O Brasil está entre os maiores exportadores de laranja e seus derivados. Entretanto, a citricultura brasileira é constantemente ameaçada por pragas e doenças, entre elas, a gomose e a podridão de raízes, ambas causadas por Phytophthora parasitica. Sabe-se que as espécies de Phytophthora secretam centenas de proteínas efetoras que contribuem para o processo infeccioso. A manipulação da ação das moléculas efetoras pode levar à perda de virulência dos patógenos e até indução de defesa nas plantas. Muito pouco se sabe sobre o funcionamento dos efetores e no contexto da citricultura o conhecimento é praticamente nulo. Deste modo, propõe-se neste projeto um estudo focando efetores de P. parasitica quando em interação com citros. Os objetivos principais são: 1) identificar candidatos e efetores em geral e particularmente dos grupos RxLR e CRN no genoma e transcriptoma de P. parasitica, e 2) avaliar a expressão destes genes antes e durante infecção em paralelo com sintomas e respostas de defesa das plantas. O projeto será dividido em duas fases, a primeira tratará da identificação dos candidatos a efetores no genoma de P. parasitica (através de pipeline com ferramentas de bioinformática) e avaliará a expressão diferencial de genes candidatos em contato com extratos de raízes de citros. Na segunda fase serão avaliadas a expressão de efetores gerais, RxLR e CRN durante os primeiros estágios da infecção em paralelo com respostas fisiológicas e ativação de genes relacionados a defesa. As informações provenientes deste estudo poderão ser utilizadas no desenvolvimento de estratégias de controle de doenças mais eficientes em citros.

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DALIO, RONALDO J. D.; HERLIHY, JOHN; OLIVEIRA, TIAGO S.; MCDOWELL, JOHN M.; MACHADO, MARCOS. Effector Biology in Focus: A Primer for Computational Prediction and Functional Characterization. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 31, n. 1, p. 22-33, JAN 2018. (15/14498-6, 14/50880-0)

DALIO, R. J. D.; MAXIMO, H. J.; OLIVEIRA, T. S.; DIAS, R. O.; BRETON, M. C.; FELIZATTI, H.; MACHADO, M.. Phytophthora parasitica Effector PpRxLR2 Suppresses Nicotiana benthamiana Immunity. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 31, n. 4, p. 481-493, APR 2018. (15/14498-6)

DURIGAN DALIO, RONALDO JOSE; MAXIMO, HEROS JOSE; OLIVEIRA, TIAGO SILVA; AZEVEDO, THAMARA DE MEDEIROS; FELIZATTI, HENRIQUE LEME; CAMPOS, MAGNOLIA DE ARAUJO; MACHADO, MARCOS ANTONIO. Molecular Basis of Citrus sunki Susceptibility and Poncirus trifoliata Resistance Upon Phytophthora parasitica Attack. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 31, n. 3, p. 386-398, MAR 2018. (08/57909-2, 15/14498-6, 14/50880-0)

RONALDO JOSÉ DURIGAN DALIO; PAULO JOSÉ CAMARGO DOS SANTOS; HEROS JOSÉ MÁXIMO; PAMELA AYUMI KAWAKAMI; EDUARDO GOULIN; MARCOS ANTÔNIO MACHADO. Agrotransformação de Phytophthora nicotianae: um método simplificado e otimizado. Summa Phytopathologica, v. 42, n. 3, p. 254-256, 2016-09-00. (15/14498-6)

DALIO, RONALDO J. D.; PASCHOAL, DANIELE; ARENA, GABRIELLA D.; MAGALHAES, DIOGO M.; OLIVEIRA, TIAGO S.; MERFA, MARCUS V.; MAXIMO, HEROS J.; MACHADO, MARCOS A.. Hypersensitive response: From NLR pathogen recognition to cell death response. Annals of Applied Biology, v. 178, n. 2, SI, NOV 2020. (15/14498-6, 19/23030-9, 14/50880-0, 13/01412-0, 14/00366-8, 19/23043-3)

DALIO, RONALDO J. D.; MAGALHAES, DIOGO M.; RODRIGUES, CAROLINA M.; ARENA, GABRIELLA D.; OLIVEIRA, TIAGO S.; SOUZA-NETO, REINALDO R.; PICCHI, SIMONE C.; MARTINS, PAULA M. M.; SANTOS, PAULO J. C.; MAXIMO, HEROS J.; et al. PAMPs, PRRs, effectors and R-genes associated with citrus-pathogen interactions. ANNALS OF BOTANY, v. 119, n. 5, p. 749-774, MAR 2017. (13/01395-9, 14/19375-7, 13/21924-6, 15/14498-6)

DALIO, R. J. D.; FLEISCHMANN, F.; CHAMBERY, A.; EICHMANN, R.; MASSOLA, JR., N. S.; PASCHOLATI, S. F.; OSSWALD, W.. Immunodepletion alpha-plurivorin effector leads to loss of virulence of Phytophthora plurivora towards Fagus sylvatica. FOREST PATHOLOGY, v. 47, n. 5, OCT 2017. (15/14498-6)

MAXIMO, HEROS J.; DALIO, RONALDO J. D.; RODRIGUES, CAROLINA M.; BRETON, MICHELE C.; MACHADO, MARCOS A.. Reference genes for RT-qPCR analysis in Citrus and Poncirus infected by zoospores of Phytophthora parasitica. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 42, n. 2, p. 76-85, APR 2017. (15/14498-6, 08/57909-2)

MAXIMO, HEROS J.; DALIO, RONALDO J. D.; DIAS, RENATA O.; LITHOLDO JR, CELSO G.; FELIZATTI, HENRIQUE L.; MACHADO, MARCOS A.. PpCRN7 and PpCRN20 of Phythophthora parasitica regulate plant cell death leading to enhancement of host susceptibility. BMC PLANT BIOLOGY, v. 19, n. 1, DEC 6 2019. (15/14498-6)