Metiloma e expressão alelo específica em bovinos Nelore extremos para eficiência alimentar

• Processo: 15/17802-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2015
• Vigência (Término): 30 de abril de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Simone Cristina Méo Niciura
• Beneficiário: Marina Ibelli Pereira Rocha
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 18/06785-3 - Perfil de metilação e análises de co-metilação em bovinos Nelore extremos para eficiência alimentar, BE.EP.DR
• Assunto(s): Epigênese genética Análise de sequência de RNA Epigenômica Consumo alimentar residual Biologia molecular Metilação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Consumo alimentar residual | epigenética | Expressão alelo específica | metilação | RNA-seq | Biologia Molecular

Resumo

Devido à grande importância da pecuária para a economia brasileira, muitos são os estudos baseados no melhoramento e na seleção precoce de animais superiores para características de interesse, como eficiência alimentar (EA) e, mais especificamente, consumo alimentar residual (CAR). Os recentes avanços no estudo do genoma, especialmente em métodos de sequenciamento de nova geração de DNA e RNA (RNA-seq), têm ajudado na compreensão dos mecanismos de regulação da expressão gênica e, consequentemente, da biologia dessas características. O estudo do epigenoma adiciona muitas informações à relação entre genótipo, ambiente e fenótipo. Diferenças na metilação entre alelos podem contribuir para a expressão diferencial e estudos demonstraram que a expressão alelo específica (EAE), está associada à metilação alelo específica (MAE). Além disso, a análise epigenética ampla é necessária para, juntamente com os dados de GWAS (genome wide association study), integrar os dados de SNPs e haplótipos com EAE e MAE. Assim, o presente projeto tem como objetivo analisar o perfil de EAE ao longo do transcriptoma, em fígado, e comparar esse perfil entre animais com fenótipos extremos para o CAR. Além disso, analisar o metiloma para identificação de regiões diferencialmente metiladas (RDM) entre os animais com fenótipos extremos. Os resultados obtidos serão integrados a dados prévios de GWAS e de genes diferencialmente expressos. A análise da metilação será realizada com o enriquecimento do DNA metilado por imunoprecipitação, tratamento com bissulfito de sódio e sequenciamento no HiSeq2000 (Illumina). Portanto, o desenvolvimento deste projeto irá adicionar novas camadas de informação aos resultados já obtidos permitindo maior enriquecendo das informações utilizadas para o melhoramento e seleção animal.