Genes funcionais do ciclo biogeoquímico do metano em áreas de floresta e pastagem na Amazônia

• Processo: 15/23758-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2016
• Vigência (Término): 31 de dezembro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
• Pesquisador responsável: Tsai Siu Mui
• Beneficiário: Jéssica Adriele Mandro
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/50320-4 - Dimensões US-BIOTA - São Paulo: pesquisa colaborativa: integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo de áreas de alteração do uso da terra em florestas tropicais, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Microbiologia do solo Ecologia microbiana Biogeoquímica Metano Archaea Uso do solo Reação em cadeia da polimerase em tempo real Bacia amazônica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ciclo biogeoquímico do metano | Ecologia microbiana | mudança de uso do solo | PCR quantitativo em tempo-real | Microbiologia do Solo

Resumo

A Bacia Amazônica é recoberta pela maior floresta tropical existente, na qual aproximadamente 15% de sua cobertura original foi substituída por áreas destinadas a suprir a crescente demanda mundial por alimentos, em um processo que altera as propriedades físicas, químicas e biológicas originais do solo. A diversidade do solo é constituída principalmente por microrganismos dos domínios Archaea e Bacteria, necessários ao funcionamento dos ecossistemas terrestres pelo seu papel na ciclagem de nutrientes e nos ciclos biogeoquímicos. Contudo, esses respondem rapidamente ao processos de mudança de uso do solo, de forma a constituir uma importante ferramenta para a análise da qualidade do ambiente e propiciar parâmetros comparativos entre os mesmos. Nesse sentido, o uso antrópico do solo tem o potencial de alterar o fluxo de gases do solo pelo seu efeito na estrutura e funcionamento da microbiota, incluindo a associada ao ciclo biogeoquímico do metano (CH4), o segundo mais importante gás do efeito estufa. O intercâmbio de metano do solo com a atmosfera e, consequentemente, a sua quantidade na mesma, é regulado por microrganismos metanogênicos, arquéias produtoras de metano; e metanotróficos, bactérias consumidoras desse mesmo gás, de modo que os dois grupos diferenciam-se de acordo com suas características ecológicas e bioquímicas únicas. Dentro desse contexto, a técnica de PCR quantitativo em tempo-real (qPCR), que permite o cálculo da quantidade inicial de genes de interesse em amostras ambientais, pode ser utilizada para detectar e quantificar as comunidades de Archaea e Bacteria do solo, assim como especificamente seus representantes metanogênicos, pela análise do gene mcrA, e metanotróficos, pelos genes pmoA e mmoX, respectivamente. Portanto, objetivo do projeto de pesquisa é determinar o efeito do uso do solo sobre a abundância de comunidades de Archaea e Bacteria, com ênfase em genes funcionais associados ao ciclo biogeoquímico do metano, em áreas sob diferentes usos no estado do Pará, na Amazônia Oriental.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO; NAKAMURA, FERNANDA MANCINI; GONTIJO, JULIA BRANDAO; DA FRANCA, ALINE GIOVANA; YOSHIURA, CAIO AUGUSTO; MANDRO, JESSICA ADRIELE; TSAI, SIU MUI. Robust DNA protocols for tropical soils. HELIYON, v. 6, n. 5, MAY 2020. (15/12282-6, 15/08564-6, 15/13546-7, 18/14974-0, 15/19979-2, 14/50320-4, 15/23758-1)

MANDRO, JESSICA A.; NAKAMURA, FERNANDA M.; GONTIJO, JULIA B.; TSAI, SIU M.; VENTURINI, ANDRESSA M.. Metagenome-Assembled Genomes from Amazonian Soil Microbial Consortia. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 11, n. 11, p. 5-pg., 2022-10-27. (14/50320-4, 15/12282-6, 15/23758-1, 15/13546-7, 19/26029-1, 18/14974-0, 19/25931-3)