Análise da variação alélica em genes de importância econômica entre regiões hom(e)ólogas do genoma de cana-de-açúcar (Saccharum spp.)

• Processo: 15/24346-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de março de 2016
• Vigência (Término): 23 de novembro de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Anete Pereira de Souza
• Beneficiário: Carla Cristina da Silva
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Duplicação gênica Polimorfismo de um único nucleotídeo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biblioteca de BACs | cana-de-açúcar | Duplicação gênica | SNPs | variação alélica | Genética e Genômica Vegetal

Resumo

A cultura da cana-de-açúcar possui grande importância econômica devido à produção de açúcar e etanol, sendo o Brasil o maior produtor mundial de cana. Os cultivares modernos de cana-de-açúcar são híbridos interespecíficos (Saccharum officinarum x S. spontaneum), sendo seu genoma poliploide e aneuploide, fato que dificulta a construção de mapas genéticos e identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci). O conhecimento da variação na sequência de bases de diferentes alelos possibilita a obtenção de informações da variação inter e intra-genótipos de uma espécie. Uma técnica eficiente para se acessar a variação alélica entre locos hom(e)ólogos em uma espécie é através do sequenciamento de locos gênicos específicos e de interesse, identificados em clones BAC (Bacterial Artificial Chromosomes). Desta maneira, o presente projeto visa a descoberta e análise de polimorfismos alélicos existentes em regiões cromossômicas hom(e)ólogas de cana-de-açúcar e comparar a organização alélica entre estas regiões através da utilização de genes que codificam uma proteína DnaJ e uma Trealose-6-fosfato sintase/fosfatase. SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) encontrados serão utilizados para avaliar a expressão gênica de haplótipos específicos e poderão ser integrados a mapas genéticos em desenvolvimento. A análise destas regiões aliada a técnica de FISH (Fluorescent in Situ Hybridization) possibilitará a localização física dos genes estudados. No caso específico de cana-de-açúcar, a identificação da expressão alelo específica pode ajudar a explicar os mecanismos de expressão de cada dose de cada alelo. (AU)

Publicações científicas

(6)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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