Estimação da interação genótipo-ambiente utilizando norma de reação genômica e análise da rede gênica para características reprodutivas de bovinos da raça Nelore

• Processo: 15/25356-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2016
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Lucia Galvão de Albuquerque
• Beneficiário: Lúcio Flávio Macedo Mota
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/16118-5 - Ferramentas genômicas no melhoramento genético de características de importância econômica direta em bovinos da raça Nelore, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/02291-3 - Busca de efeitos pleiotrópicos sobre características reprodutivas em bovinos Nelore, considerando interação genótipo ambiente, BE.EP.DR
• Assunto(s): Genômica Interação gene-ambiente
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: interação genótipo-ambiente | marcadores SNP | rede gênica | Genômica

Resumo

A criação de bovinos de corte no Brasil é realizada, predominantemente, a pasto sob uma grande diversidade de ambientes, com variações tanto no nível de alimentação e manejo como de natureza climática. Animais avaliados em diferentes ambientes podem apresentar uma resposta diferenciada em decorrência das variações ambientais, com mudanças nas variâncias dos valores genéticos e/ou na classificação destes animais, caracterizando a interação genótipo-ambiente (G×E). Atualmente, as interações G×E podem ser estudadas com auxílio de informações moleculares (marcadores SNPs). Isto possibilita a estimativa dos efeitos dos SNPs e a predição dos valores genéticos genômicos para os candidatos à seleção em diferentes ambientes. Além disto, as estimativas dos efeitos dos SNPs podem ser utilizadas para a identificação das regiões genômicas que afetam a expressão das características nos diversos gradientes ambientais. Com base nestas informações é possível realizar a prospecção dos genes candidatos e das vias biológicas associadas com as características em cada ambiente. O objetivo do presente projeto é avaliar a interação genótipo-ambiente utilizando informações genômicas, visando identificar a plasticidade do valor genético genômico bem como as possíveis mudanças dos genes candidatos e das vias biológicas associadas com a expressão das características reprodutivas de bovinos da raça Nelore de acordo com os gradientes ambientais. Serão consideradas, no presente estudo, as seguintes características: idade ao primeiro parto (IPP), ocorrência de prenhez precoce (OPP), reconcepção de fêmeas primíparas (REC) e perímetro escrotal (PE). Para a avaliação da G×E será utilizada uma abordagem de norma de reação incluindo a informação genômica. Os grupos ambientais serão definidos em função dos animais nascidos na mesma fazenda, de mesma safra e sexo e que tenham sido manejados juntos até o momento da expressão do fenótipo de interesse. A incorporação da informação genômica na análise será realizada por meio da construção de uma matriz de relacionamento genético resultante do processo que combina as matrizes de parentesco aditivo e genômica. Os efeitos estimados para os marcadores SNPs, em cada ambiente, serão obtidos a partir dos valores genéticos genômicos preditos para os animais genotipados em cada grupo ambiental e, com base nestes efeitos, serão investigadas as possíveis mudanças dos genes candidatos bem como das vias biológicas de maior importância sobre a expressão das características em análise, em diferentes ambientes.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MOTA, L. F. M.; FERNANDES, JR., G. A.; HERRERA, A. C.; SCALEZ, D. C. B.; ESPIGOLAN, R.; MAGALHAES, A. F. B.; CARVALHEIRO, R.; BALDI, F.; ALBUQUERQUE, L. G.. Genomic reaction norm models exploiting genotype x environment interaction on sexual precocity indicator traits in Nellore cattle. ANIMAL GENETICS, v. 51, n. 2, p. 210-223, MAR 2020. (17/02291-3, 09/16118-5, 15/25356-8)

MOTA, LUCIO F. M.; LOPES, FERNANDO B.; FERNANDES JUNIOR, GERARDO A.; ROSA, GUILHERME J. M.; MAGALHAES, ANA F. B.; CARVALHEIRO, ROBERTO; ALBUQUERQUE, LUCIA G.. Genome-wide scan highlights the role of candidate genes on phenotypic plasticity for age at first calving in Nellore heifers. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, APR 15 2020. (09/16118-5, 15/25356-8, 17/02291-3)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MOTA, Lúcio Flávio Macedo. Estimação da interação genótipo-ambiente utilizando norma de reação genômica e análise da rede gênica para características reprodutivas de bovinos da raça Nelore. 2019. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal Jaboticabal.