Abordagem de Biologia de Sistemas Para a Determinação de Mecanismos Moleculares Associados à Eficiência Alimentar de Bovinos Nelore

• Processo: 15/22276-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de março de 2016
• Vigência (Término): 31 de janeiro de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Heidge Fukumasu
• Beneficiário: Pâmela Almeida Alexandre
• Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/07566-2 - Genômica aplicada à produção de ruminantes, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/14707-0 - Análises ômicas multi-teciduais para caracterizar a eficiência alimentar em bovinos de corte, BE.EP.DR
• Assunto(s): Transcriptômica Análise de sequência de RNA Epigenômica Gado Nelore Epigênese genética Eficiência alimentar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: eficiência alimentar | epigenética | Multi-tecido | Nelore | RNA-seq | Transcriptômica | Melhoramento Genético Animal e Biotecnologia

Resumo

O aumento da produtividade, da lucratividade e a diminuição do impacto ambiental da pecuária estão entre os principais objetivos de seleção em bovinos de corte e podem ser alcançado através da identificação de animais com alta eficiência alimentar (EA). Por ser uma característica influenciada por diferentes processos biológicos, o entendimento de sua regulação a nível molecular é fundamental para a identificação de animais superiores com rapidez e menor custo. Verificamos anteriormente que animais com baixa EA tem maior deposição de gordura, colesterol, GGT e apresentam transcriptoma hepático associado à inflamação e metabolismo de lipídeos. Neste projeto, o objetivo é determinar um modelo de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar em bovinos Nelore utilizando uma abordagem de biologia de sistemas baseada na integração de análises genômicas, transcriptômicas e epigenômicas em múltiplos tecidos. Para tanto, 16 animais avaliados como extremos de EA tiveram coletadas amostras de hipófise, hipotálamo, adrenal e intestino delgado. Através de análises de expressão e co-expressão gênica serão identificados genes reguladores e mecanismos biológicos centrais da EA. Posteriormente, serão identificados polimorfismos funcionais associados à EA e finalmente, serão determinados mecanismos epigenéticos responsáveis pelos resultados encontrados anteriormente através da avaliação de ilhas CpG hipermetiladas e expressão de miRNAs. Acreditamos que a integração de dados ômicos avaliados em múltiplos tecidos nos permitirá propor um modelo biológico para compreensão sistêmica da eficiência alimentar, direcionando futuras abordagens de seleção e manejo dos animais.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ALEXANDRE, PAMELA A.; NAVAL-SANCHEZ, MARINA; PORTO-NETO, LAERCIO R.; FERRAZ, JOSE BENTO S.; REVERTER, ANTONIO; FUKUMASU, HEIDGE. Systems Biology Reveals NR2F6 and TGFB1 as Key Regulators of Feed Efficiency in Beef Cattle. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, MAR 22 2019. (17/14707-0, 15/22276-3, 14/07566-2, 14/02493-7)

ALEXANDRE, PAMELA A.; REVERTER, ANTONIO; BEREZIN, ROBERTA B.; PORTO-NETO, LAERCIO R.; RIBEIRO, GABRIELA; SANTANA, MIGUEL H. A.; FERRAZ, JOSE BENTO S.; FUKUMASU, HEIDGE. Exploring the Regulatory Potential of Long Non-Coding RNA in Feed Efficiency of Indicine Cattle. GENES, v. 11, n. 9, SEP 2020. (17/14707-0, 15/22276-3, 14/07566-2)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ALEXANDRE, Pâmela Almeida. Abordagem de biologia de sistemas para a determinação de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar de bovinos Nelore. 2019. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Zootecnica e Engenharia de Alimentos (FZE/BT) Pirassununga.