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Retroelementos em tumores primários e metastáticos de câncer colorretal

Processo: 15/25020-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2016
Vigência (Término): 31 de agosto de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Pedro Alexandre Favoretto Galante
Beneficiário:Fernanda Orpinelli Ramos Do Rego
Instituição-sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):17/23575-0 - Estudo sistemático de inserções de Alu em câncer, BE.EP.DR
Assunto(s):Neoplasias colorretais   Biologia computacional   Metástase   Neoplasias

Resumo

O câncer colorretal (CRC) é o terceiro tipo de câncer mais comum em todo o mundo, com mais de 1 milhão de novos casos diagnosticados anualmente. Destes novos casos, cerca de 50% dos pacientes evoluem a óbito principalmente em decorrência do desenvolvimento de tumores secundários, metastáticos, originados a partir dos tumores colorretais primários. Portanto, estudar variações genéticas em tumores secundários é de fundamental importância para se entender melhor a progressão tumoral e proporcionar tratamentos mais efetivos a pacientes acometidos com o CRC. Neste projeto de doutorado vamos desenvolver e utilizar metodologias de bioinformática, agregar dados de sequenciamento de DNA de segunda geração, informações de expressão gênica e epigenéticas para estudar variações genômicas presentes em tumores primários e metastáticos de CRCs. Entre as variações, desenvolveremos métodos para identificar e avaliar o papel funcional daquelas causadas por retrocópias de genes codificadores e Alus, dois tipos pouco explorados de variações genômicas e com grande potencial de serem funcionais. Em termos de resultados, esperamos, de maneira original, ser o primeiro grupo a catalogar eventos somáticos de retrocópias de genes codificadores e Alus em tumores secundários (metastáticos) de CRC. Também pretendemos ser pioneiros na investigação sistemática da possível relação causal entre a ocorrências destas variações geradas por retroelementos e a tumorigênesis para o CRC. De maneira geral, o nosso trabalho pretende investigar dois tipos de variações ainda pouco estudas, sobretudo em tumores secundários, e contribuir para se buscar um entendimento da frequência e importância destas variações na tumorigênesis e na metástase de um tipo muito importante de câncer, o câncer colorretal.