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Análise genômica de dados populacionais em Casearia sylvestre de diferentes fitofisionomias brasileiras

Processo: 16/05765-3
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2016
Vigência (Término): 30 de novembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Maria Imaculada Zucchi
Beneficiário:João Paulo Gomes Viana
Supervisor no Exterior: Julian Catchen
Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Illinois at Urbana-Champaign, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:13/05762-6 - Genômica da conservação em Casearia Sylvestris no cerrado e na Mata Atlântica do Sudeste do Brasil, BP.DR
Assunto(s):Diversidade genética   Medicamentos fitoterápicos   Polimorfismo de um único nucleotídeo   Marcador molecular

Resumo

Entre as etapas mais importantes e mais elaboradas do estudo da genômica populacional de espécies vegetais com o uso de Sequenciamento de Nova Geração estão o processamento e a análise dos dados. Este processo requer além de recursos computacionais avançados, um conhecimento e domínio de ferramentas de Bioinformática específicas para as técnicas aplicadas neste projeto. No Brasil, esta área tem sido pouco explorada e carece de pesquisadores no campo da genômica da adaptação, uma área recente que foi impulsionada pelo advento do sequenciamento de nova geração. Por este motivo, a presente proposta visa a concessão de bolsa para o estágio com o Dr. Julian Catchen, professor assistente da Universidade de Illinois, Estados Unidos, excelência no campo da Bioinformática aplicada a Genômica Populacional bem como no desenvolvimento das principais ferramentas usadas na análise de dados desta natureza na atualidade. Este estágio capacitará o aluno para o desenvolvimento desta etapa de sua pesquisa bem como possibilitará a implementação desta área no grupo de pesquisa.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GOMES VIANA, JOAO PAULO; BOHRER MONTEIRO SIQUEIRA, MARCOS VINICIUS; ARAUJO, FABIANO LUCAS; GRANDO, CAROLINA; SUJII, PATRICIA SANAE; SILVESTRE, ELLIDA DE AGUIAR; NOVELLO, MARIANA; PINHEIRO, JOSE BALDIN; CAVALLARI, MARCELO MATTOS; BRANCALION, PEDRO H. S.; RODRIGUES, RICARDO RIBEIRO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; CATCHEN, JULIAN; ZUCCHI, MARIA I. Genomic diversity is similar between Atlantic Forest restorations and natural remnants for the native tree Casearia sylvestris Sw.. PLoS One, v. 13, n. 3 MAR 7 2018. Citações Web of Science: 1.

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