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Estudos de diversidade microbiana no zoo de São Paulo - apoio de bioinformática

Processo: 16/09565-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de julho de 2016
Vigência (Término): 31 de julho de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:João Carlos Setubal
Beneficiário:Antonio Díaz Tula
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:11/50870-6 - Estudos da diversidade microbiana no Parque Zoológico do Estado de São Paulo, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Compostagem   Biologia computacional   Alouatta   Metagenômica   Ecologia microbiana

Resumo

Este projeto tem por objetivo geral coletar, analisar e prospectar dados moleculares de três microbiomasexistentes no Parque Zoológico do Estado de São Paulo: compostagem vegetal da mata atlântica, lago, efezes de macacos bugio. A escolha destes três microbiomas contempla a diversidade de ambientes noparque e a missão de preservação de animais da Fundação PZSP. O projeto dará continuidade a outroprojeto financiado pela FAPESP (processo 2009/52030-5R) o qual focaliza somente a unidade decompostagem do parque. O projeto fará uso de diversas metodologias, sendo as principais ametagenômica por pirossequenciamento, a identificação dos isolados microbianos por espectrofotometriade massa, e bioinformática. Como resultados esperados incluem-se diversos bancos de dados, doiswebsites, uma coleção de isolados, publicações científicas de alto nível e material de divulgação paraeducação em microbiologia junto aos visitantes do parque e para ensino fundamental e médio. O projetoinclui pesquisadores da USP (campi Butantan e Zona Leste), da UNIFESP (campi Vila Clementino eDiadema), e da Fundação Parque Zoológico de São Paulo. O projeto atende à chamada do programaBIOTA-microorganismos dando ênfase aos seguintes aspectos: caracterização da biodiversidade demicroorganismos e de biomas específicos, com prospecção e o estabelecimento de coleções de linhagensmicrobianas; desenvolvimento de estratégias para a rápida identificação e transferência de linhagens compotencial de aplicação biotecnológica e industrial; e bioprospecção de produtos microbianos.O candidato à bolsa TT-5 irá dar o apoio de bioinformática ao projeto, tendo as seguintes tarefas, entre outras: download, testes e utilização de programas de terceiros para análise de dados, desenvolvimento de software para análise de dados, gerenciamento dos dados gerados no projeto, submissão de dados gerados para repositórios públicos, confecção de gráficos e tabelas para publicações, e contribuição para publicações do projeto de uma forma geral.

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