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Aspectos funcionais e estruturais de duas proteínas de ligação de DNA codificadas pela Corynebacterium pseudotuberculosis

Processo: 16/08104-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2016
Vigência (Término): 30 de junho de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Convênio/Acordo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Raghuvir Krishnaswamy Arni
Beneficiário:Raphael Josef Eberle
Instituição-sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Ressonância magnética nuclear   Corynebacterium pseudotuberculosis   Cristalografia

Resumo

O DNA é a molécula responsável por transportar o código biológico e as informações de todas as proteínas na célula. É altamente sensível a mutações podendo resultar na morte celular. As proteínas MutY e MuG são parte da via de reparo por excisão de bases (do inglês: Base Excision Repair - BER), o qual protege o DNA contra mutações. A especificidade deste mecanismo, os conceitos básicos moleculares e estruturais, e até mesmo a inibição da função são os nossos interesses para compreender o mecanismo de ação dessas enzimas. Assim como, o desenho e desenvolvimento de inibidores. Este patógeno tem uma importância na economia mundial com grandes perdas na produção de carne, leite e produção de lã. Diversos países têm tido prejuízos de milhões de dólares por ano, como por exemplo, o Nordeste brasileiro, onde detém o maior rebanho caprino do Brasil. E a Austrália, que teve em um ano, prejuízos de 35 milhões de dólares. A investigação estrutural, biofísica e bioquímica pode fornecer informações importantes sobre o drogabilidade dos alvos em estudo.Pesquisa funcional e estrutural de proteínas é uma linhas fundamentais de pesquisa do Centro Multiusuário de Inovação Biomolecular (CMIB) situado na Universidade do Estado de São Paulo-UNESP (São José do Rio Preto) (http://www.cmib-unesp.com/). (AU)

Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PEINADO, RAFAELA DOS S.; OLIVIER, DANILO S.; EBERLE, RAPHAEL J.; DE MORAES, FABIO R.; AMARAL, MARCOS S.; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A. Binding studies of a putative C. pseudotuberculosis target protein from Vitamin B-12 Metabolism. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, APR 23 2019. Citações Web of Science: 0.
EBERLE, RAPHAEL J.; CORONADO, MONIKA A.; PEINADO, RAFAELA S.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DREYER, THIAGO; LOPES, DEBORA DE OLIVEIRA; ROSA DA LUZ, BRENDA SILVA; AZEVEDO, VASCO; ARNI, RAGHUVIR K. The polyanions heparin and suramin impede binding of free adenine to a DNA glycosylase from C. pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 125, p. 459-468, MAR 15 2019. Citações Web of Science: 0.
CORONADO, MONIKA APARECIDA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; BLEFFERT, NICOLE; FEUERSTEIN, SOPHIE; OLIVIER, DANILO SILVA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; WILLBOLD, DIETER; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Zika virus NS2B/NS3 proteinase: A new target for an old drug - Suramin a lead compound for NS2B/NS3 proteinase inhibition. Antiviral Research, v. 160, p. 118-125, DEC 2018. Citações Web of Science: 6.
EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DO AMARAL, MARCOS S.; TASIC, LJUBICA; AMI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A. Inhibition of thioredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis by polyanions and flavonoids. International Journal of Biological Macromolecules, v. 117, p. 1066-1073, OCT 1 2018. Citações Web of Science: 0.
CORONADO, MONIKA APARECIDA; OLIVIER, DANILO DA SILVA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; DO AMARAL, MARCOS SERROU; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Modeling and molecular dynamics indicate that snake venom phospholipase B-like enzymes are Ntn-hydrolases. Toxicon, v. 153, p. 106-113, OCT 2018. Citações Web of Science: 1.
EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; TASIC, LJUBICA; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A. Biochemical and biophysical characterization of a mycoredoxin protein glutaredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 107, n. B, p. 1999-2007, FEB 2018. Citações Web of Science: 1.
CORONADO, MONIKA A.; CARUSO, ICARO P.; DE OLIVEIRA, VINICIUS M.; CONTESSOTO, VINICIUS G.; LEITE, VITOR B. P.; KAWAI, LIEGE A.; ARNI, RAGHUVIR K.; EBERLE, RAPHAEL J. Cold Shock Protein A from Corynebacterium pseudotuberculosis: Role of Electrostatic Forces in the Stability of the Secondary Structure. PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, v. 24, n. 4, p. 358-367, 2017. Citações Web of Science: 6.

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