Bolsa 16/09320-6 - Transcriptoma, Genômica - BV FAPESP
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Análise integrada de expressão diferencial de miRNAs e mRNAs associados a cromossomos B no ciclídeo Astatotilapia latifasciata

Processo: 16/09320-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2016
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2018
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:Jordana Inácio Nascimento Oliveira
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Assunto(s):Transcriptoma   Genômica   Eucariotos   Cromossomos B   Astatotilapia latifasciata
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:cromossomos supernumerários | Genômica | microRNoma | Transcriptoma | Genética Animal

Resumo

Os cromossomos supernumerários B (Bs) são encontrados em uma variedade de organismos eucariotos. Não seguem os padrões de segregação da herança mendeliana e possuem seu próprio mecanismo de transmissão (drive). Mecanismo esse ainda pouco compreendido. A constituição dos Bs revela um mosaico de sequências, que inclui DNA repetitivos, genes e pseudogenes. Estudos tem relacionado esse elemento a diversas funções, como variabilidade gênica entre populações, efeitos na fertilidade, adaptação e ponte evolutiva para a origem de cromossomos sexuais. Em alguns grupos de ciclídeos africanos tem se observado a presença do B, podendo ser exclusiva de um sexo ou estar presente em ambos. Na espécie Astatotilapia latifasciata esse cromossomo está presente tanto em macho como em fêmea. No entanto, pouco se sabe sobre a função e comportamento desse elemento no genoma. Dados em larga escala de transcriptomas e microRNomas para esse ciclídeo, tem revelado a atividade transcricional diferencial entre os sexos e, ainda, entre indivíduos B- e B+. Desta forma, as perspectivas para investigação sob o foco funcional mostra-se bastante promissora para o entendimento do comportamento desse cromossomo. Este trabalho tem como objetivo compreender a relação entre transcritos de mRNA e miRNA em gônadas de A. latifasciata, que possam estar ligadas ao fator sexo e presença do cromossomo B, por meio da validação de expressão diferencial dos transcritos reportados nas bibliotecas de mRNA e microRNA. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OLIVEIRA, JORDANA INACIO NASCIMENTO; CARDOSO, ADAUTO LIMA; WOLF, IVAN RODRIGO; DE OLIVEIRA, ROGERIO ANTONIO; MARTINS, CESAR. First characterization of PIWI-interacting RNA clusters in a cichlid fish with a B chromosome. BMC Biology, v. 20, n. 1, p. 18-pg., . (15/16661-1, 16/09320-6, 17/25193-7)
NASCIMENTO-OLIVEIRA, JORDANA INACIO; FANTINATTI, BRUNO EVARISTO ALMEIDA; WOLF, IVAN RODRIGO; CARDOSO, ADAUTO LIMA; RAMOS, ERICA; RIEDER, NATHALIE; DE OLIVEIRA, ROGERIO; MARTINS, CESAR. Differential expression of miRNAs in the presence of B chromosome in the cichlid fish Astatotilapia latifasciata. BMC Genomics, v. 22, n. 1, . (15/16661-1, 17/25193-7, 16/09320-6)

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