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Caracterização molecular, filogenia e evolução de vírus transmitidos por ácaros Brevipalpus spp. no Brasil

Processo: 16/01960-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2016
Vigência (Término): 26 de outubro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
Pesquisador responsável:Juliana de Freitas Astúa
Beneficiário:Camila Chabi de Jesus
Instituição-sede: Instituto Biológico (IB). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/08458-9 - Vírus de plantas transmitidos por Brevipalpus (Acari: Tenuipalpidae) - VTB: levantamento, identificação, caracterização molecular, filogenia; relações vírus/vetor/hospedeira; biologia, taxonomia e manejo do vetor, AP.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):19/08186-2 - Filodinâmica do citrus leprosis virus C nas Américas: origem, diversificação e dispersão do principal agente causal da leprose dos citros, BE.EP.DR
Assunto(s):Ácaros parasitos de plantas   Brevipalpus   Vírus de plantas   Dichorhavirus   Variação genética   Sequenciamento de nova geração

Resumo

Acredita-se que o Brasil é o centro de diversidade de vírus transmitidos por ácaros dogênero Brevipalpus (VTB). Alguns desses VTB infectam culturas fundamentais para oagronégocio brasileiro como citros, café e maracujá, além de várias plantas ornamentais.Na última década os genomas de três deles, Citrus leprosis virus C (CiLV-C), Orchidfleck virus (OFV) e Coffe ringspot virus (CoRSV) foram descritos, mas ainda é escassoo conhecimento sobre os genomas de outros VTB e dos processos evolutivos inerentesàs populações das espécies já conhecidas. Objetiva-se neste projeto caracterizar adiversidade genética dos VTB no Brasil, establecer suas relações filogenéticas e revelaras forças envolvidas na evolução de CiLV-C, o VTB melhor estudado até o momento.Para tanto, folhas de plantas hospedeiras de VTB com sintomas característicos serãocoletadas e, a partir de seu RNA total e mediante tecnologia NGS serão obtidos osgenomas virais. Para o estudo da história evolutiva de CiLV-C, agente causal da leprosedos citros, serão utilizadas amostras de citros e Commelina benghalensis com sintomasda doença de diferentes épocas: 1935 (a partir de amostras de citros mantidas noherbário do Instituto Biológico de São Paulo), 2006-2014 e 2016-2017. Após osequenciamento e montagem dos genomas, as sequências obtidas serão analisadasutilizando pacotes bioinformáticos específicos para estudos de população. Assequências de CiLV-C recuperadas serão comparadas com genomas virais das amostrasatuais, procurando compreender a epidemiologia molecular deste vírus. Do ponto devista prático o presente projeto pode contribuir com o desenvolvimento de ferramentasde diagnósticos moleculares e a geração de informação necessária para o manejo econtrole das doenças causadas pelos VTB estudados. (AU)

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CHABI-JESUS, CAMILA; RAMOS-GONZALEZ, PEDRO L.; POSTCLAM-BARRO, MATHEUS; FONTENELE, RAFAELA SALGADO; HARAKAVA, RICARDO; BASSANEZI, RENATO B.; MOREIRA, ALECIO S.; KITAJIMA, ELLIOT W.; VARSANI, ARVIND; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Molecular Epidemiology of Citrus Leprosis Virus C: A New Viral Lineage and Phylodynamic of the Main Viral Subpopulations in the Americas. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 12, APR 29 2021. Citações Web of Science: 0.
RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; DOS SANTOS, GUSTAVO FRANCISCO; CHABI-JESUS, CAMILA; HARAKAVA, RICARDO; KITAJIMA, ELLIOT W.; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Passion Fruit Green Spot Virus Genome Harbors a New Orphan ORF and Highlights the Flexibility of the 5 `-End of the RNA2 Segment Across Cileviruses. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 11, FEB 14 2020. Citações Web of Science: 0.
RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; DA COSTA-RODRIGUES, MARIANE; POTSCLAM-BARRO, MATHEUS; CHABI-JESUS, CAMILA; BANGUELA-CASTILLO, ALEXANDER; HARAKAVA, RICARDO; KITAJIMA, ELLIOT W.; FREITAS-ASTUA, JULIANA. First genome sequence of an isolate of hibiscus chlorotic ringspot virus from the Western hemisphere. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 45, n. 2 FEB 2020. Citações Web of Science: 0.
AMARASINGHE, GAYA K.; AYLLON, MARIA A.; BAO, YIMING; BASLER, CHRISTOPHER F.; BAVARI, SINA; BLASDELL, KIM R.; BRIESE, THOMAS; BROWN, PAUL A.; BUKREYEV, ALEXANDER; BALKEMA-BUSCHMANN, ANNE; BUCHHOLZ, URSULA J.; CHABI-JESUS, CAMILA; CHANDRAN, KARTIK; CHIAPPONI, CHIARA; CROZIER, IAN; DE SWART, RIK L.; DIETZGEN, RALF G.; DOLNIK, OLGA; DREXLER, JAN F.; DUERRWALD, RALF; DUNDON, WILLIAM G.; DUPREX, W. PAUL; DYE, JOHN M.; EASTON, ANDREW J.; FOOKS, ANTHONY R.; FORMENTY, PIERRE B. H.; FOUCHIER, RON A. M.; FREITAS-ASTUA, JULIANA; GRIFFITHS, ANTHONY; HEWSON, ROGER; HORIE, MASAYUKI; HYNDMAN, TIMOTHY H.; JIANG, DAOHONG; KITAJIMA, ELLIOTT W.; KOBINGER, GARY P.; KONDO, HIDEKI; KURATH, GAEL; KUZMIN, IVAN V.; LAMB, ROBERT A.; LAVAZZA, ANTONIO; LEE, BENHUR; LELLI, DAVIDE; LEROY, ERIC M.; LI, JIANRONG; MAES, PIET; MARZANO, SHIN-YI L.; MORENO, ANA; MUHLBERGER, ELKE; NETESOV, SERGEY V.; NOWOTNY, NORBERT; NYLUND, ARE; OKLAND, ARNFINN L.; PALACIOS, GUSTAVO; PALYI, BERNADETT; PAWESKA, JANUSZ T.; PAYNE, SUSAN L.; PROSPERI, ALICE; RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; RIMA, BERTUS K.; ROTA, PAUL; RUBBENSTROTH, DENNIS; SHI, MANG; SIMMONDS, PETER; SMITHER, SOPHIE J.; SOZZI, ENRICA; SPANN, KIRSTEN; STENGLEIN, MARK D.; STONE, DAVID M.; TAKADA, AYATO; TESH, ROBERT B.; TOMONAGA, KEIZO; TORDO, NOEL; TOWNER, JONATHAN S.; VAN DEN HOOGEN, BERNADETTE; VASILAKIS, NIKOS; WAHL, VICTORIA; WALKER, PETER J.; WANG, LIN-FA; WHITFIELD, ANNA E.; WILLIAMS, JOHN V.; ZERBINI, F. MURILO; ZHANG, TAO; ZHANG, YONG-ZHEN; KUHN, JENS H. Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2019. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 164, n. 7, p. 1967-1980, JUL 2019. Citações Web of Science: 17.
RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; CHABI-JESUS, CAMILA; BANGUELA-CASTILLO, ALEXANDER; TASSI, ALINE DANIELE; RODRIGUES, MARIANE DA COSTA; KITAJIMA, ELLIOT WATANABE; HARAKAVA, RICARDO; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Unveiling the complete genome sequence of clerodendrum chlorotic spot virus, a putative dichorhavirus infecting ornamental plants. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 163, n. 9, p. 2519-2524, SEP 2018. Citações Web of Science: 2.
CHABI-JESUS, C.; RAMOS-GONZALEZ, P. L.; TASSI, A. D.; GUERRA-PERAZA, O.; KITAJIMA, E. W.; HARAKAVA, R.; BESERRA, JR., J. E. A.; SALAROLI, R. B.; FREITAS-ASTUA, J. Identification and Characterization of Citrus Chlorotic Spot Virus, a New Dichorhavirus Associated with Citrus Leprosis-Like Symptoms. PLANT DISEASE, v. 102, n. 8, p. 1588-1598, AUG 2018. Citações Web of Science: 7.
RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; CHABI-JESUS, CAMILA; GUERRA-PERAZA, ORLENE; TASSI, ALINE DANIELE; KITAJIMA, ELLIOT WATANABE; HARAKAVA, RICARDO; SALAROLI, RENATO BARBOSA; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Citrus leprosis virus N: A New Dichorhavirus Causing Citrus Leprosis Disease. PHYTOPATHOLOGY, v. 107, n. 8, p. 963-976, AUG 2017. Citações Web of Science: 13.

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