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Estudo da função do fator de transcrição da família MarR CV3905 de Chromobacterium Violaceum

Processo: 16/08728-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de agosto de 2016
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:José Freire da Silva Neto
Beneficiário:Júlia Aparecida Alves
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:12/20435-9 - Fatores de transcrição de Chromobacterium violaceum: integrando vias de sinalização, regulons e patogenicidade, AP.JP
Assunto(s):Regulação da expressão gênica   Chromobacterium violaceum   Genética bacteriana   Fatores de transcrição

Resumo

Os fatores de transcrição são proteínas regulatórias capazes de ligar em regiões específicas do DNA em resposta a sinais diversos e controlar a expressão gênica. Os fatores de transcrição da família MarR atuam como sensores diretos de sinais e controlam vários processos em bactérias, tais como virulência, resistência a antibióticos e resposta a estresse oxidativo. Chromobacterium violaceum, uma beta-proteobactéria de vida livre capaz de atuar como patógeno oportunista em humanos, possui quinze proteínas da família MarR, algumas das quais estão sendo estudadas em nosso laboratório. Este projeto tem como objetivo caracterizar a função e descobrir quais genes são regulados pelo fator de transcrição da família MarR CV3905 de C. violaceum. A definição dos genes regulados por CV3905 será feita por análises de microarranjo de DNA com subsequente validação de alguns genes selecionados. Os sítios de ligação ao DNA serão definidos por ensaios de EMSA e análises in silico. Com base no regulon encontrado para CV3905 serão realizados ensaios fenotípicos, usando uma linhagem mutante CV3905 já disponível, para descobrir a função deste fator de transcrição. Assim, os dados obtidos neste projeto deverão contribuir para entender o papel de CV3905 em C. violaceum e, de modo mais geral, aprofundar o conhecimento a respeito de fatores de transcrição da família MarR em bactérias.