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A meta-omics approach to examine disturbances in soils of the Brazilian Amazonia

Processo: 16/02219-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2016
Vigência (Término): 30 de junho de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Convênio/Acordo: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
Pesquisador responsável:Fernando Dini Andreote
Beneficiário:Victor Satler Pylro
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/50320-4 - Dimensões US-BIOTA - São Paulo: pesquisa colaborativa: integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo de áreas de alteração do uso da terra em florestas tropicais, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Ecologia microbiana

Resumo

Esta proposta busca a utilização conjunta dos métodos de sequenciamento de alto rendimento de DNA e RNA a partir de amostras ambientais, juntamente com dados de metodologias baseadas em cultivo - genômica e fisiologia, para obter informações sobre o funcionamento de comunidades microbianas em solos da Amazônia brasileira. Esta combinação constituirá um esforço para correlacionar alterações no uso do solo, com a ocorrência de grupos e processos microbianos, com foco na geração e consumo de metano. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MORAIS, DANIEL K.; ROESCH, LUIZ F. W.; REDMILE-GORDON, MARC; SANTOS, FAUSTO G.; BALDRIAN, PETR; ANDREOTE, FERNANDO D.; PYLRO, VICTOR S. BTW-Bioinformatics Through Windows: an easy-to-install package to analyze marker gene data. PeerJ, v. 6, JUL 30 2018. Citações Web of Science: 0.
MULLER BARBOZA, ANTHONY DIEGO; PYLRO, VICTOR SATLER; SEMINOT JACQUES, RODRIGO JOSEMAR; GUBIANI, PAULO IVONIR; FERREIRA DE QUADROS, FERNANDO LUIZ; DA TRINDADE, JULIO KUHN; TRIPLETT, ERIC W.; ROESCH, LUIZ. Seasonal dynamics alter taxonomical and functional microbial profiles in Pampa biome soils under natural grasslands. PeerJ, v. 6, JUN 13 2018. Citações Web of Science: 2.
RODRIGUES, EDMO MONTES; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA; PYLRO, VICTOR SATLER; REDMILE-GORDON, MARC; DE OLIVEIRA, JURACI ALVES; WURDIG ROESCH, LUIZ FERNANDO; CESAR, DIONEIA EVANGELISTA; TOTOLA, MARCOS ROGERIO. Aliphatic Hydrocarbon Enhances Phenanthrene Degradation by Autochthonous Prokaryotic Communities from a Pristine Seawater. MICROBIAL ECOLOGY, v. 75, n. 3, p. 688-700, APR 2018. Citações Web of Science: 2.
PYLRO, VICTOR SATLER; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; ANDREOTE, FERNANDO DINI; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO; FASANELLA ANDREOTE, CRISTIANE CIPOLLA; DE ALMEIDA BERNARDO, EDUARDO ROBERTO; ZUCCHI, TIAGO. Closed Genome Sequence of Phytopathogen Biocontrol Agent Bacillus velezensis Strain AGVL-005, Isolated from Soybean. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 7 FEB 2018. Citações Web of Science: 0.
LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO; DE SOUZA, ROSINEIDE CARDOSO; CANNAVAN, FABIANA DE SOUZA; PATRICIO, ANDRE; PYLRO, VICTOR SATLER; HANADA, ROGERIO EIJI; MUI, TSAI SIU. Metagenome sequencing of the microbial community of two Brazilian anthropogenic Amazon dark earth sites, Brazil. GENOMICS DATA, v. 10, p. 167-168, DEC 2016. Citações Web of Science: 0.

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