Biomarcadores clínicos em tumores do sistema nervoso central

• Processo: 16/15485-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2016
• Vigência (Término): 30 de setembro de 2017
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Houtan Noushmehr
• Beneficiário: Camila Ferreira de Souza
• Supervisor: Steven N. Kalkanis
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Henry Ford Health System, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 14/08321-3 - Identificação e caracterização de elementos genômicos funcionais associados com a progressão de gliomas de baixo grau a gliomas de alto grau: estudo integrado do genoma e epigenoma, BP.PD
• Assunto(s): Neoplasias Epigenômica Meningioma Glioma Biomarcadores
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Central Nervous System Tumors | Clinical Biomarkers | DNA methylation | glioma | meningioma | Prognostication | Epigenomics in CNS Tumors

Resumo

Efeitos nocivos e prejudiciais na cromatina global e no perfil epigenômico, na expressão gênica e no fenótipo celular têm sido associados ao câncer. Os estudos de associação em escala pós-genômica oferecem um modelo para investigação conjunta da informação contida no genoma, epigenoma e transcriptoma, proporcionando-nos uma excelente oportunidade para compreender como doenças complexas se desenvolvem ao nível global do genoma. Gliomas e meningiomas recorrentes são tumores que se desenvolvem no sistema nervoso central (SNC), comumente não respondem à terapia padrão ouro e resultam em prognóstico desfavorável ao paciente. Alterações na metilação do DNA caracterizam o epigenoma de distintos tipos de tumores do SNC. A taxonomia molecular definida por estudos globais do epigenoma é capaz de recapitular anormalidades que são inerentes ao epigenoma de células neoplásicas agressivas e recorrentes. Nesta proposta, nossa principal meta consiste em caracterizar as alterações na metilação do DNA como as principais candidatas para o desenvolvimento de biomarcadores prognósticos em gliomas e meningiomas agressivos e recorrentes. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MALTA, TATHIANE M.; DE SOUZA, CAMILA F.; SABEDOT, THAIS S.; SILVA, TIAGO C.; MOSELLA, MARITZA S.; KALKANIS, STEVEN N.; SNYDER, JAMES; CASTRO, ANA VALERIA B.; NOUSHMEHR, HOUTAN. Glioma CpG island methylator phenotype (G-CIMP): biological and clinical implications. NEURO-ONCOLOGY, v. 20, n. 5, p. 608-620, MAY 2018. (16/06488-3, 16/15485-8, 14/08321-3, 16/12329-5, 16/10436-9, 15/07925-5, 16/01975-3, 14/02245-3, 16/01389-7, 16/11039-3)

DE SOUZA, CAMILA FERREIRA; SABEDOT, THAIS S.; MALTA, TATHIANE M.; STETSON, LINDSAY; MOROZOVA, OLENA; SOKOLOV, ARTEM; LAIRD, PETER W.; WIZNEROWICZ, MACIEJ; IAVARONE, ANTONIO; SNYDER, JAMES; et al. A Distinct DNA Methylation Shift in a Subset of Glioma CpG Island Methylator Phenotypes during Tumor Recurrence. CELL REPORTS, v. 23, n. 2, p. 637-651, APR 10 2018. (14/03989-6, 16/15485-8, 16/06488-3, 14/08321-3, 16/12329-5, 16/01975-3, 14/02245-3, 15/07925-5)

ALDAPE, KENNETH; AMIN, SAMIRKUMAR B.; ASHLEY, DAVID M.; BARNHOLTZ-SLOAN, JILL S.; BATES, AMANDA J.; BEROUKHIM, RAMEEN; BOCK, CHRISTOPH; BRAT, DANIEL J.; CLAUS, ELIZABETH B.; COSTELLO, JOSEPH F.; et al. Glioma through the looking GLASS: molecular evolution of diffuse gliomas and the Glioma Longitudinal Analysis Consortium. NEURO-ONCOLOGY, v. 20, n. 7, p. 873-884, JUL 2018. (16/15485-8, 14/08321-3, 15/07925-5)

MALTA, TATHIANE M.; SOKOLOV, ARTEM; GENTLES, ANDREW J.; BURZYKOWSKI, TOMASZ; POISSON, LAILA; WEINSTEIN, JOHN N.; KAMINSKA, BOZENA; HUELSKEN, JOERG; OMBERG, LARSSON; GEVAERT, OLIVIER; et al. Machine Learning Identifies Stemness Features Associated with Oncogenic Dedifferentiation. Cell, v. 173, n. 2, p. 338+, APR 5 2018. (16/06488-3, 14/08321-3, 15/07925-5, 16/01975-3, 16/01389-7, 16/15485-8, 14/02245-3, 16/10436-9, 16/12329-5)

MAZOR, TALI; CHESNELONG, CHARLES; PANKOV, ALEKSANDR; JALBERT, LLEWELLYN E.; HONG, CHIBO; HAYES, JOSIE; SMIRNOV, IVAN V.; MARSHALL, ROXANNE; SOUZA, CAMILA F.; SHEN, YAOQING; et al. Clonal expansion and epigenetic reprogramming following deletion or amplification of mutant IDH1. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 114, n. 40, p. 10743-10748, OCT 3 2017. (16/15485-8, 14/08321-3, 15/07925-5)