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Biomarcadores clínicos em tumores do sistema nervoso central

Processo: 16/15485-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2016
Vigência (Término): 30 de setembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Houtan Noushmehr
Beneficiário:Camila Ferreira de Souza
Supervisor: Steven N. Kalkanis
Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Local de pesquisa: Henry Ford Health System, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:14/08321-3 - Identificação e caracterização de elementos genômicos funcionais associados com a progressão de gliomas de baixo grau a gliomas de alto grau: estudo integrado do genoma e epigenoma, BP.PD
Assunto(s):Neoplasias   Epigenômica   Meningioma   Glioma   Biomarcadores
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Central Nervous System Tumors | Clinical Biomarkers | DNA methylation | glioma | meningioma | Prognostication | Epigenomics in CNS Tumors

Resumo

Efeitos nocivos e prejudiciais na cromatina global e no perfil epigenômico, na expressão gênica e no fenótipo celular têm sido associados ao câncer. Os estudos de associação em escala pós-genômica oferecem um modelo para investigação conjunta da informação contida no genoma, epigenoma e transcriptoma, proporcionando-nos uma excelente oportunidade para compreender como doenças complexas se desenvolvem ao nível global do genoma. Gliomas e meningiomas recorrentes são tumores que se desenvolvem no sistema nervoso central (SNC), comumente não respondem à terapia padrão ouro e resultam em prognóstico desfavorável ao paciente. Alterações na metilação do DNA caracterizam o epigenoma de distintos tipos de tumores do SNC. A taxonomia molecular definida por estudos globais do epigenoma é capaz de recapitular anormalidades que são inerentes ao epigenoma de células neoplásicas agressivas e recorrentes. Nesta proposta, nossa principal meta consiste em caracterizar as alterações na metilação do DNA como as principais candidatas para o desenvolvimento de biomarcadores prognósticos em gliomas e meningiomas agressivos e recorrentes. (AU)

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MAZOR, TALI; CHESNELONG, CHARLES; PANKOV, ALEKSANDR; JALBERT, LLEWELLYN E.; HONG, CHIBO; HAYES, JOSIE; SMIRNOV, IVAN V.; MARSHALL, ROXANNE; SOUZA, CAMILA F.; SHEN, YAOQING; et al. Clonal expansion and epigenetic reprogramming following deletion or amplification of mutant IDH1. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 114, n. 40, p. 10743-10748, . (16/15485-8, 14/08321-3, 15/07925-5)
ALDAPE, KENNETH; AMIN, SAMIRKUMAR B.; ASHLEY, DAVID M.; BARNHOLTZ-SLOAN, JILL S.; BATES, AMANDA J.; BEROUKHIM, RAMEEN; BOCK, CHRISTOPH; BRAT, DANIEL J.; CLAUS, ELIZABETH B.; COSTELLO, JOSEPH F.; et al. Glioma through the looking GLASS: molecular evolution of diffuse gliomas and the Glioma Longitudinal Analysis Consortium. NEURO-ONCOLOGY, v. 20, n. 7, p. 873-884, . (16/15485-8, 14/08321-3, 15/07925-5)
DE SOUZA, CAMILA FERREIRA; SABEDOT, THAIS S.; MALTA, TATHIANE M.; STETSON, LINDSAY; MOROZOVA, OLENA; SOKOLOV, ARTEM; LAIRD, PETER W.; WIZNEROWICZ, MACIEJ; IAVARONE, ANTONIO; SNYDER, JAMES; et al. A Distinct DNA Methylation Shift in a Subset of Glioma CpG Island Methylator Phenotypes during Tumor Recurrence. CELL REPORTS, v. 23, n. 2, p. 637-651, . (14/03989-6, 16/15485-8, 16/06488-3, 14/08321-3, 16/12329-5, 16/01975-3, 14/02245-3, 15/07925-5)
MALTA, TATHIANE M.; SOKOLOV, ARTEM; GENTLES, ANDREW J.; BURZYKOWSKI, TOMASZ; POISSON, LAILA; WEINSTEIN, JOHN N.; KAMINSKA, BOZENA; HUELSKEN, JOERG; OMBERG, LARSSON; GEVAERT, OLIVIER; et al. Machine Learning Identifies Stemness Features Associated with Oncogenic Dedifferentiation. Cell, v. 173, n. 2, p. 338+, . (16/06488-3, 14/08321-3, 15/07925-5, 16/01975-3, 16/01389-7, 16/15485-8, 14/02245-3, 16/10436-9, 16/12329-5)
MALTA, TATHIANE M.; DE SOUZA, CAMILA F.; SABEDOT, THAIS S.; SILVA, TIAGO C.; MOSELLA, MARITZA S.; KALKANIS, STEVEN N.; SNYDER, JAMES; CASTRO, ANA VALERIA B.; NOUSHMEHR, HOUTAN. Glioma CpG island methylator phenotype (G-CIMP): biological and clinical implications. NEURO-ONCOLOGY, v. 20, n. 5, p. 608-620, . (16/06488-3, 16/15485-8, 14/08321-3, 16/12329-5, 16/10436-9, 15/07925-5, 16/01975-3, 14/02245-3, 16/01389-7, 16/11039-3)

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