Análise integrativa do microRNAoma no músculo esquelético de Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu) e seu híbrido, tambacu

• Processo: 15/19985-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Pesquisador responsável: Maeli Dal Pai
• Beneficiário: Bruno Evaristo de Almeida Fantinatti
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/15708-0 - Bioinformática aplicada a microRNAs de peixes, BE.EP.PD
• Assunto(s): Sistema musculoesquelético Músculo esquelético Crescimento muscular Peixes
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Crescimento muscular | microRNAoma | Músculo esquelético | Peixe | Aquicultura

Resumo

As espécies Colossoma macropomum (tambaqui) e Piaractus mesopotamicus (pacu) são espécies que possuem grande aceitação no mercado, e apresentam características desejáveis para produção, como por exemplo, o rápido crescimento, e ótima adaptação a diferentes tipos de alimentação. Estas espécies possuem grande semelhança em termos de hábito alimentar, mas apresentam variação em termos de melhor temperatura para produção. No entanto, os indivíduos originados à partir da hibridização entre estas duas espécies, o tambacu, apresentam capacidade de se adaptar a temperaturas de aproximadamente 20°C (característico do pacu), e podem alcançar um ganho de peso aproximado do tambaqui, características desejáveis para o ambiente de produção. MicroRNAs são pequenas moléculas de RNA capazes de controlar a atividade gênica de forma pós-transcricional, podendo ser utilizados em análises genômicas, para analisar fatores que controlam as diferentes taxas de crescimento. Com o advento das novas tecnologias de sequenciamento, a análise em larga escala de microRNAs representa uma alternativa extremamente eficaz na caracterização dessas moléculas, bem como na análise do seu papel no controle pós transcricional de genes e na predição de vias de sinalização envolvidas com os processos celulares através da constução de redes. O tecido muscular dos peixes possui grande interesse para a produção, pois representa uma importante fonte de proteínas utilizada na alimentação. Desta forma, o presente projeto visa analisar dados de microRNAoma de forma integrada entre músculos brancos de indivíduos juvenis das espécies tambaqui, pacu e no híbrido tambacu, com o objetivo de identificar os perfis transcricionais de microRNAs envolvidos com o crescimento muscular. A análise da interação microRNA-mRNA, possibilitará um melhor conhecimento sobre a ação dessas pequenas moléculas no controle da expressão de genes envolvidos com o crescimento muscular de modo a identificar fatores que estejam compartilhados entre os genótipos. Tal estudo poderá contribuir para a identificação de marcadores relacionados com o crescimento muscular.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FANTINATTI, BRUNO E. A.; PEREZ, ERIKA S.; ZANELLA, BRUNA T. T.; VALENTE, JESSICA S.; DE PAULA, TASSIANA G.; MARECO, EDSON A.; CARVALHO, ROBSON F.; PIAZZA, SILVANO; DENTI, MICHELA A.; DAL-PAI-SILVA, MAELI. Integrative microRNAome analysis of skeletal muscle of Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu), and the hybrid tambacu, based on next-generation sequencing data. BMC Genomics, v. 22, n. 1, APR 6 2021. (16/05009-4, 15/19985-2, 17/15708-0)

FANTINATTI, BRUNO E. A.; PEREZ, ERIKA S.; ZANELLA, BRUNA T. T.; VALENTE, JESSICA S.; DE PAULA, TASSIANA G.; MARECO, EDSON A.; CARVALHO, ROBSON F.; PIAZZA, SILVANO; DENTI, MICHELA A.; DAL-PAI-SILVA, MAELI. Integrative microRNAome analysis of skeletal muscle of Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu), and the hybrid tambacu, based on next-generation sequencing data. BMC Genomics, v. 22, n. 1, p. 17-pg., 2021-04-06. (16/05009-4, 15/19985-2, 17/15708-0)