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Visualização de dados genômicos, anotação integrativa e análise correlacional entre medidas fenotípicas e transcritos diferencialmente expressos em músculo de bovinos Nelore

Processo: 16/16556-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de outubro de 2016
Vigência (Término): 30 de setembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luciana Correia de Almeida Regitano
Beneficiário:Bruno Gabriel Nascimento Andrade
Instituição-sede: Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:12/23638-8 - Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore, AP.TEM
Assunto(s):Análise de sequência de RNA

Resumo

Web Apollo é uma plataforma de edição de anotações de genomas online e possui como vantagem o fato de que anotadores podem trabalhar colaborativamente em tempo real, já que mudanças são armazenadas em nuvem. Esta plataforma permite operações de edição como a deleção, divisão e fusão de transcritos assim como a modificação de limites de exons, tendo sido utilizado com sucesso na edição de genomas bovinos. Utilizando esta ferramenta nós pretendemos integrar dados genômicos, transcriptômicos e fenotípicos para uma melhor anotação do genoma de um touro da raça Nelore. Utilizaremos também diversas ferramentas, como Ensembl-Biomart e Phenotest para identificar transcritos diferencialmente expressos e correlacioná-los a fenótipos extremos, como maciez de carne e gordura intramuscular.