Busca avançada
Ano de início
Entree

Estudos funcionais de proteínas candidatas a efetores durante a interação Sporisorium scitamineum x cana

Processo: 16/16376-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2016
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
Pesquisador responsável:Claudia Barros Monteiro Vitorello
Beneficiário:Natália de Sousa Teixeira e Silva
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):17/25477-5 - Identificação de candidatos a interação e vias de respostas globais ativadas por efetores de Sporisorium scitamineum, BE.EP.DR
Assunto(s):Genômica funcional   Interação planta-patógeno

Resumo

O carvão da cana-de-açúcar é uma doença cosmopolita de grande importância para o agronegócio, uma vez que pode afetar a produtividade da cultura. A doença é causada pelo fungo basiodiomiceto Sporisorium scitamineum, espécie biotrófica que coloniza exclusivamente a cana-de-açúcar. A interação cana-carvão vem sendo estudada pelo nosso grupo de pesquisa nos últimos anos em seus vários aspectos considerando as atividades de ataque e defesa do patógeno e da planta, respectivamente. Este projeto tem como finalidade estudar proteínas candidatas a efetores neste patossistema. Efetores são essenciais para alterar o metabolismo hospedeiro de forma a permitir a colonização da planta pelo patógeno. A identificação de tais proteínas auxilia no reconhecimento de genes de resistência podendo gerar informações relevantes a programas de melhoramento genético na produção de variedades resistentes. Com base no genoma completamente sequenciado de S. scitamineum serão selecionados in silico genes que codificam proteínas candidatas a efetores (TANIGUTI et al., 2015). As estratégias de seleção utilizadas terão como base características da sequencia de aminoácidos traduzida, a expressão diferencial de genes do fungo in planta, obtidos anteriormente em experimentos de RNAseq (SCHAKER et al., submetido), e estudos de diversidade genética (BENEVENUTO et al., submetido). Os candidatos serão analisados quanto à localização subcelular in planta por meio de agroinfiltração para a expressão transiente em Nicotiana benthamiana. Posteriormente, serão realizados ensaios de co-imunoprecipitação para captura e avaliação de moléculas de interação direta aos candidatos a efetores. Os genes candidatos terão seus níveis de expressão validados por RT-qPCR. Estes resultados servirão de subsídio para estudos futuros sobre os níveis de virulência dos diferentes isolados do patógeno bem como para auxiliar a tomada de decisão em programas de melhoramento genético de variedades resistentes ao carvão da cana.

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PETERS, L. P.; TEIXEIRA-SILVA, N. S.; BINI, A. P.; SILVA, M. M. L.; MORAES, N.; CRESTANA, G. S.; CRESTE, S.; AZEVEDO, R. A.; CARVALHO, G.; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.. Differential responses of genes and enzymes associated with ROS protective responses in the sugarcane smut fungus. FUNGAL BIOLOGY, v. 124, n. 12, p. 1039-1051, . (17/13268-2, 13/15014-7, 16/17545-8, 18/07615-4, 16/16376-8)
BENEVENUTO, JULIANA; TEIXEIRA-SILVA, NATALIA S.; KURAMAE, EIKO E.; CROLL, DANIEL; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA B.. Comparative Genomics of Smut Pathogens: Insights From Orphans and Positively Selected Genes Into Host Specialization. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 9, . (14/21802-0, 17/13268-2, 16/03768-5, 16/17545-8, 16/16376-8)
TEIXEIRA-SILVA, NATALIA SOUSA; CARVALHO SCHAKER, PATRICIA DAYANE; SILVA RODY, HUGO VIANNA; MAIA, THIAGO; GARNER, CHRISTOPHER M.; GASSMANN, WALTER; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS. Leaping into the Unknown World of Sporisorium scitamineum Candidate Effectors. JOURNAL OF FUNGI, v. 6, n. 4, . (16/04429-0, 17/13268-2, 13/25599-2, 18/04555-0, 17/25477-5, 16/17545-8, 16/16376-8)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SILVA, Natália de Sousa Teixeira e. Análise funcional de proteínas candidatas a efetores durante a interação Sporisorium scitamineum x cana. 2019. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.