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Triagem por agrupamentos biossintéticos dos micro-organismos Streptomyces sp B1 e Streptomyces wadayamensis

Processo: 16/19370-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de novembro de 2016
Vigência (Término): 30 de junho de 2017
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Pesquisador responsável:Luciana Gonzaga de Oliveira
Beneficiário:Fernanda Bacciotti
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/12727-5 - Genome mining em Streptomyces, AP.R
Assunto(s):Streptomyces   Mineração de genoma   Policetídeos

Resumo

A análise recente do genoma de diversas linhagens de Streptomyces revelou uma grande abundância de clusters de genes que codificam enzimas do metabolismo secundário. Esse conjunto de informações confere uma importante evidência de que a capacidade para a produção de metabólitos por Streptomyces e outras actinobactérias não é completamente acessada sob as condições de cultivo em laboratório. Como uma alternativa as metodologias de buscas tradicionais por novos metabólitos, a aplicação de ferramentas genômicas iniciadas principalmente neste século, tem possibilitado o e isolamento de novas moléculas, elucidação de vias biossintéticas, caracterização de inúmeras enzimas e suas funções e também a identificação de intermediários de biossíntese. As linhagens endofíticas de Streptomyces wadayamensis e Streptomyces sp. isoladas de Citrus ssp foram sequenciadas recentemente pelo nosso grupo de pesquisas utilizando tecnologia Illumina MiSeq. Foram encomendadas a eleboração da construção da biblioteca genômica em vetor do tipo ESAC (E. coli-Streptomyces Artificial Chromosome) com a empresa Bio S&T Inc., Montreal, Canadá, especializada e exclusiva na construção deste tipo de biblioteca utilizando linhagens de Streptomyces. Em princípio a empresa realizou a triagem de 5 agrupamentos de genes na biblioteca de Streptomyces sp B1. Como é interesse do grupo de pesquisas fazer uma ampla exploração dos agrupamentos de genes mapeados nas duas linhagens, pretendemos fazer o processo de triagem no Brasil de todos os agrupamentos de genes de interesse.