Associação e predição genômica de componentes principais de características de crescimento e escores visuais em bovinos da raça nelore

• Processo: 15/25449-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2016
• Vigência (Término): 31 de dezembro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Roberto Carvalheiro
• Beneficiário: Giovana Vargas
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/03331-9 - Estudo de associação genômica ampla de componentes principais de características de crescimento e escores visuais em bovinos da raça Nelore, BE.EP.DR
• Assunto(s): Componentes principais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: associação genômica ampla | Componentes Principais | Weighted Single Step GBLUP | Melhoramento Genético de Bovinos de Corte

Resumo

A análise de componentes principais é uma técnica da estatística multivariada que permite avaliar a magnitude da variabilidade e as inter-relações entre características de interesse. Objetiva-se com o presente projeto avaliar os componentes principais genéticos para caraterísticas de crescimento e escore visual ao desmame e sobreano de bovinos da raça Nelore, a fim de identificar a inter-relação entre estas características e explorar uma possível identificação de diferentes biotipos de animais, determinados pelos componentes principais. Além da abordagem genética quantitativa, informações genotípicas serão utilizadas para a condução de estudos de associação dos componentes principais, objetivando identificar regiões no genoma que diferenciam os animais quanto aos diferentes componentes. Por fim, predições genômicas serão conduzidas para avaliar a habilidade da informação genotípica em discriminar os animais quanto aos componentes principais e, eventualmente, quanto aos diferentes biotipos (caso eles sejam identificados na análise quantitativa). Serão utilizados dados da base Aliança Nelore com informações de, aproximadamente, 600.000 animais ao nascimento, 500.000 ao desmame e 330.000 ao sobreano, provenientes de 246 fazendas localizadas em diferentes regiões do Brasil e Paraguai. A análise de componentes principais será realizada pela reparametrização da equação de modelo misto multivariada. Os estudos de associação e predição genômica serão conduzidos considerando as metodologias weighted single step GBLUP e BayesC, utilizando como "fenótipo" os valores genéticos preditos para os componentes principais, fornecidos pela análise quantitativa. A habilidade de predição da seleção genômica será avaliada com a utilização de validação cruzada.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VARGAS, GIOVANA; SCHENKEL, FLAVIO SCHRAMM; BRITO, LUIZ FERNANDO; DE REZENDE NEVES, HAROLDO HENRIQUE; MUNARI, DANISIO PRADO; BOLIGON, ARIONE AUGUSTI; CARVALHEIRO, ROBERTO. Unravelling biological biotypes for growth, visual score and reproductive traits in Nellore cattle via principal component analysis. LIVESTOCK SCIENCE, v. 217, p. 37-43, NOV 2018. (09/16118-5, 17/03331-9, 15/25449-6)

VARGAS, GIOVANA; SCHENKEL, FLAVIO SCHRAMM; BRITO, LUIZ FERNANDO; DE REZENDE NEVES, HAROLDO HENRIQUE; MUNARI, DANISIO PRADO; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; CARVALHEIRO, ROBERTO. Genomic regions associated with principal components for growth, visual score and reproductive traits in Nellore cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 233, MAR 2020. (09/16118-5, 17/03331-9, 15/25449-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

VARGAS, Giovana. A genomic association and prediction of principal components of growth traits and visual scores in Nellore cattle. 2018. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal Jaboticabal.