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Desreplicação funcional de produtos naturais marinhos por screening citológico de imagem e metabolômica não-direcionada assistida por métodos computacionais

Processo: 16/22573-0
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de maio de 2017
Vigência (Término): 30 de abril de 2018
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Pesquisador responsável:Norberto Peporine Lopes
Beneficiário:Fausto Carnevale Neto
Supervisor no Exterior: Roger G. Linington
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Local de pesquisa : Simon Fraser University, Canadá  
Vinculado à bolsa:14/12343-2 - Desenvolvimento metodológico e estudos de prospecção de recursos biológicos marinhos com potencial citotóxico sob a óptica da biologia de sistemas, BP.PD
Assunto(s):Química de produtos naturais   Biologia computacional   Biologia de sistemas   Espectrometria de massas   Metabolômica   Citotoxicidade

Resumo

Abordagens em metabolômica usando técnicas de espectrometria de massa (EM) têm sido reconhecidas como a estratégia de escolha para explorar as diversidades químicas e de bioatividade em produtos naturais (PN). Em PN marinhos, desafios em acesso à vida marinha e de elucidação estrutural de moléculas usualmente complexas e obtidas em pequena escala exigem novas ferramentas para a identificação de compostos bioativos. Neste contexto, os métodos de desreplicação utilizando espectrometria de massa e bioensaios de high throughput screening (HTS) despontam como uma forma eficiente de identificação de compostos em extratos marinhos bioativos de origem marinha. Contudo, a falta de bases de dados espectrais robustas restringe a possibilidade de previsão e automação no processo de desreplicação. Além disso, a maioria dos bioensaios HTS são incapazes de prever os modos de ação dos metabólitos bioativos nos estádios iniciais da descoberta do NP. Neste projeto propõe-se o desenvolvimento de novas abordagens para a anotação in silico de produtos naturais baseadas nas vias de fragmentação EM/EM, considerando propriedades estruturais específicas dos compostos marinhos, i.e., "metabolite-likeness", e questões relacionadas à reatividade em fase gasosa, como ionização e reações concomitantes ácido-base e/ou redox. Adicionalmente, o projeto visa ao emprego do conceito de Mapeamento de Atividade Química para avaliar o potencial citológico e os possíveis mecanismos de ação de matrizes complexas de organismos marinhos brasileiros através do screening fenotípico via imagem de células HeLa e da análise metabolômica em alta resolução. (AU)

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