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Bioinformática na análise de expressão gênica em Leishmania

Processo: 16/16429-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2016
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
Pesquisador responsável:Angela Kaysel Cruz
Beneficiário:Patrícia de Cássia Ruy
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/50219-9 - Investigação sobre fatores e mecanismos do controle de expressão gênica em Leishmania: do papel de modificações pós-traducionais, RNAs não codificadores, cis-elementos e amplificação gênica, AP.TEM
Assunto(s):Leishmania   Biologia computacional   Análise de sequência de RNA   Expressão gênica

Resumo

O estudo proposto exige a integração de dados de análises da expressão gênica em diversos níveis; dos ncRNAs, passando por cis-elementos e modificações pós-traducionais, pela análise fenotípica de mutantes do parasito gerados neste estudo. Estas análises podem incluir transcriptômica, proteômica e metabolômica e os dados gerados precisam ser armazenados corretamente e seu resgate e integração devem ser facilitados. Dessa forma, o desenvolvimento e a integração de ferramentas computacionais que possibilitem e tratem da análise de expressão gênica são essenciais para que o grande volume de dados gerados seja aproveitado e de fato informativo. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RUY, PATRICIA DE CASSIA; MONTEIRO-TELES, NATALIA MELQUIE; MISERANI MAGALHAES, RUBENS DANIEL; FREITAS-CASTRO, FELIPE; DIAS, LEANDRO; AQUINO DEFINA, TANIA PAULA; DE VASCONCELOS, ELTON JOSE ROSAS; MYLER, PETER J.; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Comparative transcriptomics in Leishmania braziliensis: disclosing differential gene expression of coding and putative noncoding RNAs across developmental stages. RNA BIOLOGY, v. 16, n. 5, p. 639-660, MAY 4 2019. Citações Web of Science: 2.

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