| Processo: | 16/22490-8 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de janeiro de 2017 |
| Data de Término da vigência: | 24 de janeiro de 2020 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos |
| Acordo de Cooperação: | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) |
| Pesquisador responsável: | Humberto Tonhati |
| Beneficiário: | Diercles Francisco Cardoso |
| Instituição Sede: | Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 18/11460-6 - Varredura genômica ampla por loci afetados pela seleção recente em raças bovinas de corte, taurina e zebuína, através de medidas compostas, BE.EP.PD |
| Assunto(s): | Desequilíbrio de ligação Gado Nelore |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Angus | Desequilíbrio de Ligação | Murrah | Nelore | populações | Qtl | Genética de Populações, Genômica |
Resumo A seleção positiva tende a aumentar a frequência de alelos favoráveis, promovendo padrões genômicos diferenciados nas proximidades destes alelos, denominados assinaturas de seleção. A domesticação, a formação de raças e os esquemas de seleção artificial, são capazes de promover a seleção positiva e assinaturas de seleção. A identificação destas regiões tem despertado interesse da genética de populações, para decifrar as bases genéticas da diversidade fenotípica em espécies/raças, e para elucidar papel funcional de regiões genômicas e genes. Neste projeto propõem-se duas linhas paralelas de estudos, com o objetivo comum de identificação de assinaturas de seleção, sendo uma delas voltada a bovinos de corte e outra voltada a bubalinos leiteiros. Os objetivos deste projeto resumem-se a: (1) Estudar assinaturas de seleção na raça Nelore, utilizando uma população maior que as utilizadas em estudos prévios; (2) Comparar bovinos Angus e Nelore, quanto ao desequilíbrio de ligação; (3) Aplicar um método composto de identificação de assinaturas de seleção nas raças Angus e Nelore; (4) Analisar os níveis genômicos de endogamia em bubalinos; e (5) realizar os primeiros estudos sobre assinaturas de seleção na espécie bubalina. Para tanto serão utilizados aproximadamente 4000 bovinos Nelore genotipados com o painel BovineHD - 700K (Illumina), 700 bovinos Angus genotipados com o painel GGP-HD - 150K (Neogen) e 384 bubalinos da raça Murrah genotipados com o Painel Axion Buffalo - 90K (Affymetrix). A estatística iHS ("integrated Haplotype Score") será utilizada para busca por assinaturas de seleção na população Nelore (1) e em bubalinos (5). As comparações entre o desequilíbrio de ligação em Angus e Nelore (2) será realizada através da análise do decaimento do desequilíbrio e fase de ligação nas duas raças, além de comparações regionais nos padrões de desequilíbrio. O método composto de identificação de assinaturas de seleção aplicado nas populações Angus e Nelore (3) será a estatística DCMS, que combina resultados de métodos individuais de assinaturas de seleção. A endogamia genômica e a busca por regiões genômicas de baixa diversidade em bubalinos (4) contará com a estatística ROH. (AU) | |
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