Busca avançada
Ano de início
Entree

Mapeamento de assinaturas de seleção no genoma das principais espécies domésticas da tribo Bovini exploradas na pecuária, os bovinos (Bos taurus) e os bubalinos (Bubalus bubalis)

Processo: 16/22490-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2017
Vigência (Término): 24 de janeiro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Convênio/Acordo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Humberto Tonhati
Beneficiário:Diercles Francisco Cardoso
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/11460-6 - Varredura genomica ampla por loci afetados pela seleção recente em raças bovinas de corte, taurina e zebuina, através de medidas compostas., BE.EP.PD
Assunto(s):Desequilíbrio de ligação   Gado Nelore

Resumo

A seleção positiva tende a aumentar a frequência de alelos favoráveis, promovendo padrões genômicos diferenciados nas proximidades destes alelos, denominados assinaturas de seleção. A domesticação, a formação de raças e os esquemas de seleção artificial, são capazes de promover a seleção positiva e assinaturas de seleção. A identificação destas regiões tem despertado interesse da genética de populações, para decifrar as bases genéticas da diversidade fenotípica em espécies/raças, e para elucidar papel funcional de regiões genômicas e genes. Neste projeto propõem-se duas linhas paralelas de estudos, com o objetivo comum de identificação de assinaturas de seleção, sendo uma delas voltada a bovinos de corte e outra voltada a bubalinos leiteiros. Os objetivos deste projeto resumem-se a: (1) Estudar assinaturas de seleção na raça Nelore, utilizando uma população maior que as utilizadas em estudos prévios; (2) Comparar bovinos Angus e Nelore, quanto ao desequilíbrio de ligação; (3) Aplicar um método composto de identificação de assinaturas de seleção nas raças Angus e Nelore; (4) Analisar os níveis genômicos de endogamia em bubalinos; e (5) realizar os primeiros estudos sobre assinaturas de seleção na espécie bubalina. Para tanto serão utilizados aproximadamente 4000 bovinos Nelore genotipados com o painel BovineHD - 700K (Illumina), 700 bovinos Angus genotipados com o painel GGP-HD - 150K (Neogen) e 384 bubalinos da raça Murrah genotipados com o Painel Axion Buffalo - 90K (Affymetrix). A estatística iHS ("integrated Haplotype Score") será utilizada para busca por assinaturas de seleção na população Nelore (1) e em bubalinos (5). As comparações entre o desequilíbrio de ligação em Angus e Nelore (2) será realizada através da análise do decaimento do desequilíbrio e fase de ligação nas duas raças, além de comparações regionais nos padrões de desequilíbrio. O método composto de identificação de assinaturas de seleção aplicado nas populações Angus e Nelore (3) será a estatística DCMS, que combina resultados de métodos individuais de assinaturas de seleção. A endogamia genômica e a busca por regiões genômicas de baixa diversidade em bubalinos (4) contará com a estatística ROH. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NASCIMENTO, V, A.; CARDOSO, D. F.; SANTOS, D. J. A.; ROMERO, A. R. S.; SCALEZ, D. C. B.; BORQUIS, R. R. A.; NETO, F. R. A.; GONDRO, C.; TONHATI, H. Inbreeding coefficients and runs of homozygosity islands in Brazilian water buffalo. JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, v. 104, n. 2, p. 1917-1927, FEB 2021. Citações Web of Science: 1.
CARDOSO, DIERCLES FRANCISCO; FERNANDES JUNIOR, GERARDO ALVES; BECKER SCALEZ, DAIANE CRISTINA; CARVALHO ALVES, ANDERSON ANTONIO; BRAGA MAGALHAES, ANA FABRICIA; BRESOLIN, TIAGO; VENTURA, RICARDO VIEIRA; LI, CHANGXI; DE SENA OLIVEIRA, MARCIA CRISTINA; PORTO-NETO, LAERCIO RIBEIRO; CARVALHEIRO, ROBERTO; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; TONHATI, HUMBERTO; ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Uncovering Sub-Structure and Genomic Profiles in Across-Countries Subpopulations of Angus Cattle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1 MAY 29 2020. Citações Web of Science: 2.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.