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Indução metabólica guiada por análises genômicas em Burkholderia thailandensis para a biossíntese de produtos naturais com atividade antimicrobiana

Processo: 16/19269-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2017
Data de Término da vigência: 03 de abril de 2019
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:João Henrique Ghilardi Lago
Beneficiário:Joao Luiz Baldim Zanin
Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Santo André , SP, Brasil
Assunto(s):Anti-infecciosos   Produtos naturais   Betaproteobacteria
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:análises genômicas | Antimicrobianos | Betaproteobacteria | Burkholderia thailandensis | Produtos Naturais | Química dos Produtos Naturais

Resumo

Micro-organismos participam de processos biológicos muito antes de o homem descobrir as possibilidades para a sua utilização sistemática. A produção de compostos de importância farmacológica por estes seres microscópicos é bem estudada e conhecida desde a descoberta do fármaco do século, a Penicilina. Atualmente, análises genômicas têm proporcionado inúmeras descobertas de novos Produtos Naturais de micro-organismos. Para tanto, neste trabalho, objetiva-se a leitura genômica de espécies do gênero Burkholderia em algoritmos de reconhecimento de genes para a criação de perfis de resistência à antibióticos. Estes perfis de resistência determinarão os candidatos para análise de indução metabólica em um micro-organismo modelo representante do gênero Burkholderia, a espécie B. thailandensis. Micro-organismos do filo b-proteobacteria estão despontando como fontes de compostos de interesse farmacológico e/ou industrial, onde a maioria destes compostos tem sido descobertos como resultado de análises genômicas iniciais. Um exemplo clássico é a descoberta da teixobactina, através de estudos na espécie Eleftheria terrae. No projeto proposto, análises de bioinformática guiarão a composição dos meios de cultura para fontes de carbono e nitrogênio em plataformas de predição de metabolismo, como por exemplo, a plataforma KEGG. A concentração do indutor metabólico selecionado e o reconhecimento de perfis de metabolismo será determinado por comparação com a densidade optica do meio de cultura padrão (sem adição de compostos provenientes de análises genômicas) via resultados da composição química determinada por estratégias de metabolômica em CG-EM, CLAE-EM e de desreplicação. A descoberta de novos compostos será bioguiada pela atividade de extratos e partições dos extratos obtidos, frente à atividade contra micro-organismos patogênicos cruzando todas as informações provenientes de redes dinâmicas para tratamento de dados químico-biológicos. Acredita-se que estratégias racionais e modernas, como as propostas neste projeto, possam evitar gastos de recursos financeiros e tempo elevado de pesquisa na descoberta de novas moléculas que possam agir como antibióticos. (AU)

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Publicações científicas (5)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
BALDIM, JOAO LUIZ; DA SILVA, BRUNA LIDIANE; CHAGAS-PAULA, DANIELA APARECIDA; LAGO, JOAO HENRIQUE G.; SOARES, MARISI G.. . SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (16/19269-8)
SILVA, ROBSON E.; BALDIM, JOAO L.; CHAGAS-PAULA, DANIELA A.; SOARES, MARISI G.; LAGO, JOAO H. G.; GONCALVES, V, REGGIANI; NOVAES, ROMULO D.. . Biochimie, v. 152, p. 14-30, . (16/19269-8)
OLIVEIRA, EMERSON A.; MARTINS, EUDER G. A.; SOARES, MARISI G.; CHAGAS-PAULA, DANIELA A.; PASSERO, LUIZ F. D.; SARTORELLI, PATRICIA; BALDIM, JOAO L.; LAGO, JOAO HENRIQUE G.. . Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 30, n. 7, p. 1395-1405, . (16/00468-0, 18/07885-1, 16/19269-8)
BALDIM, JOAO L.; ROSA, WELTON; SILVA, THAIS A. C.; FERREIRA, DAIANE D.; TEMPONE, ANDRE GUSTAVO; DE PAULA, DANIELA APARECIDA C.; SOARES, MARISI G.; LAGO, JOAO HENRIQUE G.. . Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 36, n. 8, p. 13-pg., . (21/02789-7, 18/10279-6, 18/07885-1, 23/12447-1, 16/19269-8)
DE SOUSA, FERNANDA S.; BALDIM, JOAO L.; AZEVEDO, RICARDO A.; FIGUEIREDO, CARLOS R.; PIEPER, PAULINE; SEAR, CLAIRE E.; ANDERSON, EDWARD A.; LAGO, JOAO HENRIQUE G.. . Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, v. 30, n. 16, . (15/11936-2, 15/04143-6, 16/19269-8, 18/07885-1)