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Caracterização do gene da metiltransferase presente no cluster do antígeno-O em Burkholderiaseminalis TC3.4.2R3 e seu papel na síntese de antimicrobianos

Processo: 16/17173-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2016
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Welington Luiz de Araújo
Beneficiário:Sarina Tsui
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/04397-6 - Caracterização do gene da metiltransferase presente no cluster do antígeno-O em Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 e seu papel na síntese de antimicrobianos, BE.EP.DR
Assunto(s):Controle biológico   Repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas   Proteína 9 associada à CRISPR

Resumo

O gênero Burkholderia é formado por bactérias Gram-negativas, que possuem elevada diversidade fisiológica e genética. Burkholderia está sendo objeto de estudos que visam aplicações biotecnológicas diversas, como agentes de biocontrole, promotores de crescimento vegetal, biorremediação e como produtores de importantes moléculas de interesse. A linhagem Burkholderia seminalis TC3.4.2R3, foi isolada endofiticamente de raízes de cana-de-açúcar e apresenta a capacidade de inibir fungos e bactérias fitopatogênicas. No entanto, o conhecimento a respeito do envolvimento e os mecanismos de controle dos metabólitos com propriedades antimicrobianas em Burkholderia spp. ainda é incipiente. Dessa forma, estudos para identificar os genes de Burkholderia spp. envolvidos com a síntese de compostos antimicrobianos são necessários. O presente estudo visa avaliar a produção de compostos antimicrobianos por B. seminalis TC3.4.2R3 por meio da análise dos genes do cluster do antígeno-O responsável pela síntese de LPS (lipopolissacarídeo), como o gene de metiltransferase. Em um estudo anterior foi observado que uma mutação no gene de metiltransferase altera o padrão de interação desta B. seminalis TC3.4.2R3 com micro-organismos fitopatogênicos, o que sugere o possível envolvimento deste cluster na produção de antimicrobianos. Para tanto, será realizada a extração e caracterização do LPS de B. seminalis TC3.4.2R3 pelo método da cromatografia em camada delgada (CDD) e bioautografia dos compostos antimicrobianos. Posteriormente, os genes do cluster de síntese do antígeno-O serão nocauteados por meio do sistema CRISPR/Cas9 e a capacidade destes mutantes em inibir fitopatógenos de interesse será avaliada. Dessa forma, o principal objetivo deste projeto é uma melhor compreensão dos possíveis mecanismos envolvidos na inibição de fitopatógenos por B. seminalis TC3.4.2R3 e o papel do gene de uma metiltrasferase presente no cluster do antígeno-O neste processo.