Cruzando os rios amazônicos: um estudo comparativo entre plantas com distintas histórias de vida

• Processo: 17/02302-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 08 de março de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Lúcia Garcez Lohmann
• Beneficiário: Alison Gonçalves Nazareno
• Supervisor: Christopher William Dick
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Michigan, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 13/12633-8 - Filogeografia comparada de plantas na Amazônia Central, BP.PD
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração Amazônia Rios Genética de populações vegetais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Amazonia | ddRAD-Seq | marcadores SNPs | sequenciamento de nova geração | Genômica de populações

Resumo

A Amazônia representa um dos Biomas mais diversos no Planeta. Apesar disso, pouco ainda se sabe sobre os processos ecológicos e evolutivos que levaram às altas taxas de diversificação, manutenção e distribuição das espécies nesta região. Neste estudo, iremos amostrar quatro espécies de plantas com diferentes modos de dispersão (i.e., Amphirrhox longifolia, Buchenavia oxypetala, Passiflora spinosa e Psychotria sp.), com o objetivo de testar a Hipótese de Rios de Wallace.Embora existam muitos estudos sobre o impacto dos rios como barreiras genéticas para espécies animais, há poucos estudos que examinam cuidadosamente o impacto dos rios da Bacia Amazônica na divergência genética de espécies vegetais. Para testar a Hipótese de Wallace, 14 populações de cada espécie coletadas nas margens dos Rios Negro ou Branco serão analisadas. Utilizando o sequenciamento de nova geração, será empregada a técnica de sequenciamento massivo de sequências associadas a sítios de restrição (ddRAD-seq, double digest Restriction site Associated DNA sequencing) para identificar marcadores SNPs (Single Nucleotide Polimorphism) no genoma de 467 indivíduos amostrados. Essa metodologia é recente dentro da genética de populações, permitindo analisar um grande número de marcadores genéticos (genômica de populações). Os resultados obtidos neste estudo irão permitir determinar o padrão de diferenciação genética dentro e entre as margens dos rios, bem como verificar se estes padrões são decorrentes do isolamento geográfico. Este projeto é uma colaboração entre o Laboratório de Sistemática Vegetal (Departamento de Botânica) da Universidade de São Paulo (USP) e o Laboratório do Dr. Christopher Dick (Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva) da Universidade de Michigan (UM). Enquanto o Laboratório da Dra. Lohmann (USP) irá cobrir todos os gastos do projeto, o laboratório do Dr. Dick (UM) irá permitir a utilização de equipamentos para a geração e análise dos dados. A análise dos dados será realizada em ambas instituições, e o artigo será escrito conjuntamente entre os membros do projeto. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

NAZARENO, ALISON G.; DICK, CHRISTOPHER W.; LOHMANN, LUCIA G.. Tangled banks: A landscape genomic evaluation of Wallace's Riverine barrier hypothesis for three Amazon plant species. Molecular Ecology, v. 28, n. 5, p. 980-997, MAR 2019. (12/50260-6, 13/12633-8, 17/02302-5, 15/07141-4)

NAZARENO, ALISON G.; KNOWLES, L. LACEY; DICK, CHRISTOPHER W.; LOHMANN, LUCIA G.. By Animal, Water, or Wind: Can Dispersal Mode Predict Genetic Connectivity in Riverine Plant Species?. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, FEB 12 2021. (15/07141-4, 12/50260-6, 13/12633-8, 17/02302-5)

NAZARENO, ALISON G.; DICK, CHRISTOPHER W.; LOHMANN, LUCIA G.. A Biogeographic Barrier Test Reveals a Strong Genetic Structure for a Canopy-Emergent Amazon Tree Species. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, DEC 9 2019. (15/07141-4, 17/02302-5, 13/12633-8, 12/50260-6)