Recuperação de genomas de micro-organismos degradadores petróleo em reservatórios através de análises de sequenciamentos em larga escala

• Processo: 16/24976-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Valeria Maia Merzel
• Beneficiário: Daiane Rodrigues Barbosa Belgini
• Supervisor: Karsten Zengler
• Instituição Sede: Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Paulínia , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of California, San Diego (UC San Diego), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 15/06991-4 - Estudo das interações e funções microbianas em reservatórios de petróleo brasileiros., BP.DR
• Assunto(s): Metagenômica Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala Metatranscriptômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: metagenômica | metatranscriptômica | Recuperação de genomas | Sequenciamento em larga escala | Metagenômica e metatrancriptômica

Resumo

O presente estudo visa o desenvolvimento e aperfeiçoamento de habilidades relacionadas à análise de dados de metagenômica e metatranscriptômica da microbiota de amostras de petróleo brasileiras através de diferentes ferramentas de bioinformática. O projeto apresenta dois objetivos principais: (i) complementar com novas ferramentas e métodos as análises dos dados de sequência obtidos por metagenômica e metatranscriptômica das amostras de óleo cru e microcosmos anaeróbios a fim de elucidar os processos e vias metabólicas mais relevantes no ambiente de reservatório; e (ii) montar e recuperar genomas (in silico) a partir dos dados de seqüenciamento de larga escala disponíveis, contribuindo com informações sobre os processos atuantes na degradação de petróleo, assim como os mecanismos de sobrevivência dos micro-organismos em condições inóspitas. Para a realização de ambos os objetivos serão utilizados os dados obtidos em trabalho prévio através do seqüenciamento em larga escala de DNA de amostras de óleo bruto de reservatórios brasileiros e de DNA e RNA de microcosmos anaeróbios ativos na degradação do petróleo.