Bolsa 16/23364-6 - Biologia computacional, Sequenciamento de nova geração - BV FAPESP
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Sequenciamento de exoma em pacientes portadores de angioedema hereditario de causa desconhecida

Processo: 16/23364-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2017
Data de Término da vigência: 31 de março de 2018
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:João Bosco Pesquero
Beneficiário:Renan Paulo Martin
Supervisor: Nara Lygia de Macena Sobreira
Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Johns Hopkins University (JHU), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:14/20965-3 - Estudo in silico de mutações gênicas causadoras do angioedema hereditário, BP.PD
Assunto(s):Biologia computacional   Sequenciamento de nova geração   Angioedemas hereditários   Genômica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Angioedema Hereditário | bioinformática | Genômica | Next Generation Sequencing | phenoDB | Bioinformática

Resumo

O angioedema hereditário (HAE) é uma doença hereditária autossômica dominante caracterizada por episódios dolorosos de edema com localização e gravidade variáveis. A maioria dos pacientes diagnosticados apresenta mutação no gene C1 inibidor (C1-INH), com níveis anormais ou com deficiência funcional (HAE tipo I e II, respectivamente) ou gene do Fator 12 (FXII) (HAE Tipo 3). Estas mutações levam a uma super produção de bradicinina (BK), o peptídeo responsável pela formação de edema. Além disso, há um HAE de etiologia molecular desconhecida, onde os pacientes apresentam os mesmos sintomas, mas nenhuma mutação em ambos os genes conhecidos. A fim de descobrir possíveis genes candidatos envolvidos na fisiopatologia de HAE de base molecular desconhecida, propomos a utilização de sequenciamento de nova geração (NGS) para investigar indivíduos com HAE e sem mutação em SERPING1 ou F12. Além disso, pretendemos procurar moduladores da doença em famílias com a mesma mutação causadora e manifestações clínicas variáveis. O sequenciamento será realizado com Ion Proton no Laboratório do Prof João Bosco Pesquero e os dados adquiridos serão analisados com o software PhenoDB no laboratório do Dr. Nara Sobreira da Universidade Johns Hopkins. Os resultados do presente projeto poderam melhorar o conhecimento sobre o HAE e ajudar a melhorar os diagnóstico e a qualidade de vida dos pacientes.

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