Bolsa 16/13737-0 - Técnicas de genotipagem, Transcriptoma - BV FAPESP
Busca avançada
Ano de início
Entree

Análise do escore poligênico e caracterização do perfil de expressão gênica em crianças e adolescentes em risco para transtornos psiquiátricos

Processo: 16/13737-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2017
Data de Término da vigência: 03 de novembro de 2019
Área de conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Psiquiatria
Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Síntia Iole Nogueira Belangero
Beneficiário:Marcos Leite Santoro
Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/09328-2 - Avaliação do desempenho do escore poligênico de risco e da interação gene ambiente em uma amostra brasileira miscigenada, BE.EP.PD
Assunto(s):Técnicas de genotipagem   Transcriptoma
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Doenças Psiquiátricas | Escore poligênico de risco | Genotipagem | Predição de transtornos psiquiátricos | Psiquiatria infanto-juvenil | Transcriptoma | Psiquiatria infanto-juvenil

Resumo

Os transtornos psiquiátricos (TPs) são uma das principais causas de anos perdidos por incapacidade na população jovem mundial. Muitas dessas doenças apresentam uma alta herdabilidade, chegando a 60-80% para a esquizofrenia e o transtorno afetivo bipolar. Isso sugere que o genoma contém uma grande quantidade de informação que tem potencial de ser utilizado como marcadores genéticos de diagnóstico dessas doenças. Entretanto, a natureza poligênica dessas doenças, somada à influência de fatores ambientais dificulta a exploração dessa informação. Nos últimos anos, a expansão dos consórcios em genética psiquiátrica permitiu a criação de um escore poligênico de risco para doenças psiquiátricas (PRS) baseado em resultados de estudos genômicos em larga escala (GWAS). Uma das limitações do PRS é que ele foi criado, especialmente, para a população caucasiana, dificultando a utilização em amostras miscigenadas, como a brasileira. Ao mesmo tempo, além de se estudar variantes genômicas, as quais são imutáveis em cada indivíduo, é importante entender os mecanismos genéticos dinâmicos que se alteram durante o desenvolvimento do indivíduo, como a expressão gênica. Os objetivos dessa proposta são: 1) incrementar e 2) aplicar o PRS para a nossa amostra de crianças e adolescentes em risco para TPs; 3) caracterizar o perfil de expressão gênica em larga escala dessa amostra e 4) relacionar os dados genômicos e transcriptômicos. Para a análise do PRS utilizaremos as amostras já genotipadas (N=750) e para a análise de expressão pretendemos selecionar 240 crianças com maior e menor risco para transtornos mentais baseados na história familial; risco poligênico; risco clínico e ambiental. Nesse caso, para a expressão gênica selecionaremos 120 crianças com 1) maiores sintomas de psicopatologia, mensuradas pela Child Behavior Checklist (CBCL) e/ou 2) maior risco genético, sugerido por histórico familial para transtornos mentais e PRS obtido na etapa anterior; assim como 120 crianças controles com menores escores para esses dois itens e sem nenhum diagnóstico psiquiátrico. Utilizaremos para os arrays genômicos o Infinum® HumanCore Array e para os arrays de expressão gênica o HumanHT-12 v4 Expression BeadChip, para ambos iremos seguir o protocolo recomendado pelos fabricantes. A análise será feita inteiramente por sistemas operacionais UNIX utilizando a linguagem da linha de comando bem como o programa estatístico R, o PLINK e o PRScise. Assim, pretendemos adaptar o escore poligênico para a nossa amostra brasileira miscigenada bem como identificar um perfil de expressão gênica relacionado com o risco para transtornos mentais. Esses resultados poderão auxiliar na identificação de potenciais marcadores de risco para transtornos mentais, de forma a atuar, futuramente, na prevenção e diagnóstico precoces. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Mais itensMenos itens
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SANTORO, MARCOS LEITE; OTA, VANESSA; DE JONG, SIMONE; NOTO, CRISTIANO; SPINDOLA, LETICIA M.; TALARICO, FERNANDA; GOUYEA, EDUARDO; LEE, SANG HYUCK; MORETTI, PATRICIA; CURTIS, CHARLES; et al. Polygenic risk score analyses of symptoms and treatment response in an antipsychotic-naive first episode of psychosis cohort. TRANSLATIONAL PSYCHIATRY, v. 8, . (14/50830-2, 14/07280-1, 14/22223-4, 12/12686-1, 10/08968-6, 16/13737-0, 16/04983-7, 11/50740-5)
SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI, CLAUDINEI EDUARDO; BUENO, ANA PAULA ARANTES; CAYE, ARTHUR; PAN, PEDRO MARIO; SANTORO, MARCOS; HONORATO-MAUER, JESSICA; SALUM, GIOVANNI ABRAHAO; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; BRESSAN, RODRIGO AFFONSECA; et al. Polygenic risk score for attention-deficit/hyperactivity disorder and brain functional networks segregation in a community-based sample. GENES BRAIN AND BEHAVIOR, v. N/A, p. 9-pg., . (18/04654-9, 16/13737-0, 13/08531-5, 21/05332-8, 16/04983-7, 18/21934-5)

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas utilizando este formulário.