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Identificação e caracterização de genes candidatos a cópia única em cana-de-açúcar

Processo: 17/04427-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de maio de 2017
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Felipe Bitencourt Martins
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Cana-de-açúcar   Análise funcional   Técnicas de genotipagem   Expressão gênica

Resumo

O advento das novas tecnologias de sequenciamento permitiu a disseminação de técnicas de análise de expressão e genotipagem em larga escala e, consequentemente, muitas pesquisas nessa área estão sendo feitas, com a cana-de-açúcar não é diferente. Porém, os genes duplicados são um grande desafio na análise e interpretação dos resultados visto que torna difícil a distinção entre os alelos do loco de interesse em relação as suas cópias. Assim, identificar genes candidatos a cópia única (genes provenientes de locos não duplicados) é de suma importância para o desenvolvimento de marcadores aplicados a construção de mapas genéticos e em análises de expressão gênica. Portanto, o objetivo do projeto é identificar e fazer a anotação funcional dos possíveis genes de cópia única em variedades comerciais de cana-de-açúcar (SP80-3280 e IACSP93-3046). Os genomas de arroz, milho e sorgo serão utilizados na identificação de genes de cópia única compartilhados entre estes genomas, que servirão como referência na busca de possíveis genes não duplicados em cana-de-açúcar. Espera-se identificar genes candidatos a cópia única que sejam úteis para futuros trabalhos de expressão gênica e na construção de mapas genéticos, e que a análise funcional dos mesmos permita um maior entendimento sobre a importância e o motivo desses genes permanecerem nesta condição. (AU)